RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 OR10K2Q6IF99 312 aa-1.03□□□□□ -2.57
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SHQ1-204ENST00000468347 RAB43Q86YS6 212 aa-1.03□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 CCDC50Q8IVM0 306 aa-1.03□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa-1.03□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa-1.03□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
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SHQ1-204ENST00000468347 OR56A4Q8NGH8 313 aa-1.03□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 OR10A6Q8NH74 314 aa-1.03□□□□□ -2.57
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SHQ1-204ENST00000468347 C2orf74A8MZ97 194 aa-1.04□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 LINC01619G3V211 115 aa-1.04□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 H3BPC8 53 aa-1.04□□□□□ -2.58
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SHQ1-204ENST00000468347 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP-1.04□□□□□ -2.58
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SHQ1-204ENST00000468347 OR4A8P0C604 315 aa-1.04□□□□□ -2.58
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SHQ1-204ENST00000468347 SLC13A3Q8WWT9 602 aa-1.04□□□□□ -2.58
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SHQ1-204ENST00000468347 NAT6Q93015 286 aa-1.04□□□□□ -2.58
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