RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467246.5

HPS1-208, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HPS1, Length 2,791 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-208ENST00000467246 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 HERV-K104P61576 105 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 TGFBR3Q03167 851 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 HFEQ30201 348 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 ALKBH6Q3KRA9 238 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 LYZL2Q7Z4W2 148 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 ZNF573Q86YE8 665 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 GALNT14Q96FL9 552 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 AQP10Q96PS8 301 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 SMPD2O60906 423 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 LRP3O75074 770 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 IFNA21P01568 189 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 TCF15Q12870 199 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 HERPUD1Q15011 391 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 GABRA6Q16445 453 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 MPV17LQ2QL34 196 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 VWA1Q6PCB0 445 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 C20orf204Q6ZNR8 217 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 C9orf106Q8NAJ2 232 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 SUMF2Q8NBJ7 301 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 GLYATL2Q8WU03 294 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 RDH5Q92781 318 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 OR51I2Q9H344 312 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 GLRX2Q9NS18 164 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 MEMO1Q9Y316 297 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 AKAP13Q12802 2813 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 SPTBN2O15020 2390 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 F8W036 122 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 UCP3P55916 312 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 PPP1CBP62140 327 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 GUSBP1Q15486 140 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 WDR86Q86TI4 376 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 STOML3Q8TAV4 291 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 RSRP1Q9BUV0 290 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 GLS2Q9UI32 602 aa9.75□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 TRAV24A0A0B4J272 114 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 PRSS44E7EML9 344 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 SCGB1D2O95969 90 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 PET100P0DJ07 73 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 TPT1P13693 172 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 NFYBP25208 207 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 GNRHRP30968 328 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 FOXF2Q12947 444 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 IL24Q13007 206 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 OR2A2Q6IF42 318 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 ZNF585AQ6P3V2 769 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 FBXW12Q6X9E4 464 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 Q6ZS49 121 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 Q6ZT83 130 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 LDLRAD3Q86YD5 345 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 BAP18Q8IXM2 172 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 FAM58AQ8N1B3 248 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 GPHA2Q96T91 129 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 SLC5A7Q9GZV3 580 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 CDH20Q9HBT6 801 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 OR2S2Q9NQN1 319 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 TUBD1Q9UJT1 453 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 AQP7O14520 342 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 AGFG2O95081 481 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 HKR1P10072 659 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 SPP1P10451 314 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 AKR1C3P42330 323 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 LIAT1Q6ZQX7 453 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 SLC25A40Q8TBP6 338 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 TMED6Q8WW62 240 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 TAAR6Q96RI8 345 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 TP53RKQ96S44 253 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 SYT3Q9BQG1 590 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 COA4Q9NYJ1 87 aa9.74□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 PTPRBP23467 1997 aa9.73□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 C18orf12Q96KH6 178 aa9.73□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 SUCNR1Q9BXA5 334 aa9.73□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 DNAJB11Q9UBS4 358 aa9.73□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 CEP250Q9BV73 2442 aa9.73□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 DEDDO75618 318 aa9.73□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 DIRAS3O95661 229 aa9.73□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 TK1P04183 234 aa9.73□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 SELEP16581 610 aa9.73□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 UCP2P55851 309 aa9.73□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 NAAAQ02083 359 aa9.73□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 IGF2-ASQ6U949 168 aa9.73□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 ETV3LQ6ZN32 361 aa9.73□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 LRTM2Q8N967 370 aa9.73□□□□□ -0.85
HPS1-208ENST00000467246 OR1J1Q8NGS3 322 aa9.73□□□□□ -0.85
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