RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	SAA4	P35542	130 aa		14.5	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	DLX6	P56179	175 aa		14.5	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	LGALS4	P56470	323 aa		14.5	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	ACTG1	P63261	375 aa		14.5	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	MPV17L	Q2QL34	196 aa		14.5	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	BRICD5	Q6PL45	260 aa		14.5	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	TCF23	Q7RTU1	214 aa		14.5	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		14.5	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		14.5	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	SLC25A28	Q96A46	364 aa		14.5	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	COQ2	Q96H96	371 aa		14.5	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	14.5	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	CST11	Q9H112	138 aa		14.5	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		14.5	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		14.5	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		14.5	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	14.5	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		14.49	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	FBP1	P09467	338 aa		14.49	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		14.49	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	MGMT	P16455	207 aa		14.49	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	HTR2C	P28335	458 aa		14.49	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	14.49	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		14.49	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	NEDD8	Q15843	81 aa		14.49	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		14.49	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		14.49	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	HCP5	Q6MZN7	132 aa		14.49	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902		Q6YL49	198 aa		14.49	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	LYPD6	Q86Y78	171 aa		14.49	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	TMEM104	Q8NE00	496 aa		14.49	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		14.49	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		14.49	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		14.49	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		14.49	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	GHRL	Q9UBU3	117 aa		14.49	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	KIF25	Q9UIL4	384 aa		14.49	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	ANK2	Q01484	3957 aa		14.48	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	CLPX	O76031	633 aa		14.48	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	MPIG6B	O95866	241 aa		14.48	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	RBP4	P02753	201 aa		14.48	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	MELTF	P08582	738 aa		14.48	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	UBB	P0CG47	229 aa		14.48	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	GLP1R	P43220	463 aa		14.48	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		14.48	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		14.48	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	14.48	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		14.47	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	ARG1	P05089	322 aa		14.47	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	MYL9	P24844	172 aa		14.47	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	KCNJ3	P48549	501 aa		14.47	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	P2RY14	Q15391	338 aa		14.47	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	MIDN	Q504T8	468 aa		14.47	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		14.47	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	OR10K2	Q6IF99	312 aa		14.47	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		14.47	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		14.47	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	CORO2A	Q92828	525 aa		14.47	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	14.47	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		14.47	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	IFT22	Q9H7X7	185 aa		14.47	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	14.47	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		14.47	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		14.47	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		14.47	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		14.46	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	SLC22A1	O15245	554 aa		14.46	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	OMG	P23515	440 aa		14.46	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	CDK2	P24941	298 aa		14.46	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	RAB11B	Q15907	218 aa		14.46	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	14.46	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	C22orf42	Q6IC83	251 aa		14.46	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	RAB12	Q6IQ22	244 aa		14.46	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		14.46	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	KCNK15	Q9H427	330 aa		14.46	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		14.46	□□□□□ -0.09
USP19-210	ENST00000465902	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		14.45	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		14.45	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	FAM172BP	A6NC97	362 aa		14.45	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	BTBD17	A6NE02	478 aa		14.45	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	14.45	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	PDCD5	O14737	125 aa		14.45	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	MMP23A	O75900	390 aa		14.45	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	TNFAIP8	O95379	198 aa		14.45	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	IGHV4-59	P01825	116 aa		14.45	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	14.45	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	VSIG8	P0DPA2	414 aa		14.45	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	NFYB	P25208	207 aa		14.45	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	PSMD7	P51665	324 aa		14.45	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	14.45	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	OR52W1	Q6IF63	320 aa		14.45	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		14.45	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		14.45	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		14.45	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		14.45	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902	C17orf50	Q8WW18	174 aa		14.45	□□□□□ -0.1
USP19-210	ENST00000465902		Q96M66	194 aa		14.45	□□□□□ -0.1

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms