RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 J3QW42 95 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 BHLHE40O14503 412 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 ARPC3O15145 178 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 HSPA12AO43301 675 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 SNAPC5O75971 98 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 DUX4L2P0CJ85 424 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 DUX4L3P0CJ86 424 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 DUX4L4P0CJ87 422 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 DUX4L5P0CJ88 424 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 DUX4L6P0CJ89 424 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 DUX4L7P0CJ90 424 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 VSIG10L2P0DP72 767 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 HKR1P10072 659 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 RPA2P15927 270 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 RBP2P50120 134 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 DAP3P51398 398 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 HIST3H3Q16695 136 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 SLC35D3Q5M8T2 416 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 C10orf128Q5T292 105 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 OR52W1Q6IF63 320 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 TRAT1Q6PIZ9 186 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 ARL9Q6T311 187 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 DOK3Q7L591 496 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 CCDC54Q8NEL0 328 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 CLCC1Q96S66 551 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 GINS4Q9BRT9 223 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 OPA3Q9H6K4 179 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 SEC61A2Q9H9S3 476 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 TAS2R5Q9NYW4 299 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 DUX4Q9UBX2 424 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 HIF3AQ9Y2N7 669 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 DYSFO75923 2080 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 A0A0A6YYH2 397 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 A6NJ64 397 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 LRRN3E7EW58 273 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 XKRYO14609 159 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 DHHO43323 396 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 SCGB1D1O95968 90 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 IGHG1P01857 330 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 HLA-HP01893 362 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 IFNA6P05013 189 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 CD14P08571 375 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 UBBP0CG47 229 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
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PTPRR-204ENST00000440835 TMEM155Q4W5P6 130 aa5.09□□□□□ -1.59
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PTPRR-204ENST00000440835 SYT9Q86SS6 491 aa5.09□□□□□ -1.59
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PTPRR-204ENST00000440835 OR6V1Q8N148 313 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 BPIFB2Q8N4F0 458 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 ZBTB34Q8NCN2 500 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 NPEPL1Q8NDH3 523 aa5.09□□□□□ -1.59
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PTPRR-204ENST00000440835 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF479Q96JC4 524 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 SLITRK2Q9H156 845 aa5.09□□□□□ -1.59
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PTPRR-204ENST00000440835 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRR-204ENST00000440835 A6NIZ1 184 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRR-204ENST00000440835 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRR-204ENST00000440835 GOSR2O14653 212 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRR-204ENST00000440835 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
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PTPRR-204ENST00000440835 AKR1C3P42330 323 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRR-204ENST00000440835 HCCSP53701 268 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRR-204ENST00000440835 UCP2P55851 309 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRR-204ENST00000440835 CTXN1P60606 82 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRR-204ENST00000440835 RAB2AP61019 212 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRR-204ENST00000440835 RAP1BP61224 184 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRR-204ENST00000440835 RAP1AP62834 184 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRR-204ENST00000440835 IL13RA1P78552 427 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRR-204ENST00000440835 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
PTPRR-204ENST00000440835 SLAQ13239 276 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRR-204ENST00000440835 CDNFQ49AH0 187 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRR-204ENST00000440835 C9orf139Q6ZV77 190 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRR-204ENST00000440835 SLC35D2Q76EJ3 337 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF511Q8NB15 262 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRR-204ENST00000440835 OR52E2Q8NGJ4 325 aa5.09□□□□□ -1.6
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