RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.78□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.78□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa6.78□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KCNG3Q8TAE7 436 aa6.78□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.78□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PTX4Q96A99 478 aa6.78□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC25A46Q96AG3 418 aa6.78□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM3DQ96BQ1 224 aa6.78□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 Q96M66 194 aa6.78□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DUX4Q9UBX2 424 aa6.78□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CLN8Q9UBY8 286 aa6.78□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR14J1Q9UGF5 321 aa6.78□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.78□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PEX16Q9Y5Y5 336 aa6.78□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AUP1Q9Y679 476 aa6.78□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM82A0PJX8 343 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 H3BUI4 141 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRIM77I1YAP6 450 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 K7N7A8 449 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DEGS1O15121 323 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PSPNO60542 156 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TK1P04183 234 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CSN2P05814 226 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C4BPBP20851 252 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DUSP1P28562 367 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ETV6P41212 452 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HTR2BP41595 481 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CLDN12P56749 244 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GNB2P62879 340 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PAX5Q02548 391 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PAX2Q02962 417 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 COL10A1Q03692 680 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MXD1Q05195 221 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CD300CQ08708 224 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LRRC10Q5BKY1 277 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HES5Q5TA89 166 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CD276Q5ZPR3 534 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CYB5R2Q6BCY4 276 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BIVMQ86UB2 503 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 STX12Q86Y82 276 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR8H2Q8N162 312 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR51D1Q8NGF3 324 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM46BQ96A09 425 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SNX22Q96L94 193 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MRI1Q9BV20 369 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TM2D1Q9BX74 207 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM59Q9BXS4 323 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SHARPINQ9H0F6 387 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BANF2Q9H503 90 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPACA1Q9HBV2 294 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR5V1Q9UGF6 321 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SESN1Q9Y6P5 492 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LOC105371242A0A075B767 164 aa6.76□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.76□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A0A0B4J203 849 aa6.76□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRAV24A0A0B4J272 114 aa6.76□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.76□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SMIM30A4D0T7 59 aa6.76□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C22orf46C9J442 243 aa6.76□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SIRPB1O00241 398 aa6.76□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CD5LO43866 347 aa6.76□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MPIG6BO95866 241 aa6.76□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GLAP06280 429 aa6.76□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF44P15621 663 aa6.76□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RAB6AP20340 208 aa6.76□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GATA3P23771 443 aa6.76□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR3A1P47881 315 aa6.76□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KCNJ3P48549 501 aa6.76□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SNU13P55769 128 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LCN2P80188 198 aa6.76□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM189A2Q15884 450 aa6.76□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TAF9Q16594 264 aa6.76□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GLCCI1Q86VQ1 547 aa6.76□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.76□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LY6G5BQ8NDX9 201 aa6.76□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM185AQ8NFB2 350 aa6.76□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.7 ms