RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 CD24P25063 80 aa16.74■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 MNDAP41218 407 aa16.74■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 IL13RA2Q14627 380 aa16.74■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 C10orf67Q8IYJ2 551 aa16.74■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF565Q8N9K5 539 aa16.74■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 OR9G1Q8NH87 305 aa16.74■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 PHF21AQ96BD5 680 aa16.74■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 KIRREL1Q96J84 757 aa16.74■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa16.74■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 C9orf16Q9BUW7 83 aa16.74■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 JAM3Q9BX67 310 aa16.74■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 E9PI62 339 aa16.73■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 RAB3AP20336 220 aa16.73■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 KCNJ3P48549 501 aa16.73■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 ABCA11PQ4W5N1 156 aa16.73■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa16.73■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 OR4X2Q8NGF9 303 aa16.73■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa16.73■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 TRAV24A0A0B4J272 114 aa16.72■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 FAM90A18PA6NE21 464 aa16.72■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 FAM90A16PA6NEW6 464 aa16.72■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa16.72■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa16.72■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 FAM90A12PA8MX19 464 aa16.72■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa16.72■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 GABRPO00591 440 aa16.72■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 LPLP06858 475 aa16.72■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 FAM90A15PP0C7V4 464 aa16.72■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 FAM90A13PP0C7W8 464 aa16.72■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 FAM90A14PP0C7W9 464 aa16.72■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 FAM90A24PP0C7X0 464 aa16.72■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 THNSL2Q86YJ6 484 aa16.72■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 OR52I1Q8NGK6 324 aa16.72■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 CNIH3Q8TBE1 160 aa16.72■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 BARHL1Q9BZE3 327 aa16.72■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 CALYQ9NYX4 217 aa16.72■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa16.71■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa16.71■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 MAGEB3O15480 346 aa16.71■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 IL1AP01583 271 aa16.71■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 PF4V1P10720 104 aa16.71■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 CD33P20138 364 aa16.71■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 OR3A4PP47883 348 aa16.71■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC58Q4VC31 144 aa16.71■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 KLHL22Q53GT1 634 aa16.71■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 ASCL4Q6XD76 172 aa16.71■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa16.71■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 OR10A7Q8NGE5 316 aa16.71■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 MRAPQ8TCY5 172 aa16.71■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 SGCDQ92629 289 aa16.71■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 AMBNQ9NP70 447 aa16.71■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 KIF25Q9UIL4 384 aa16.71■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 MOB4Q9Y3A3 225 aa16.71■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa16.71■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 MEIKINA0A087WXM9 373 aa16.7■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 J3QR06 171 aa16.7■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 FAM106CPP0CH98 169 aa16.7■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 NFYBP25208 207 aa16.7■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 GLP1RP43220 463 aa16.7■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 LOXL3P58215 753 aa16.7■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 NHLRC3Q5JS37 347 aa16.7■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 UTF1Q5T230 341 aa16.7■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 OR51A2Q8NGJ7 313 aa16.7■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 OR13A1Q8NGR1 328 aa16.7■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa16.7■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 APH1BQ8WW43 257 aa16.7■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 MYDGFQ969H8 173 aa16.7■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 TOMM40LQ969M1 308 aa16.7■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 RPEQ96AT9 228 aa16.7■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 IFT22Q9H7X7 185 aa16.7■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 ING3Q9NXR8 418 aa16.7■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa16.7■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 IL36GQ9NZH8 169 aa16.7■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PRX2 142 aa16.69■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa16.69■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 HSPB6O14558 160 aa16.69■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 CD2P06729 351 aa16.69■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 LIMS3P0CW19 117 aa16.69■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 LIMS4P0CW20 117 aa16.69■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 ZSCAN26Q16670 478 aa16.69■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 FOXB2Q5VYV0 432 aa16.69■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 LPCAT4Q643R3 524 aa16.69■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 OSR2Q8N2R0 312 aa16.69■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 GPR148Q8TDV2 347 aa16.69■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 GPER1Q99527 375 aa16.69■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 SLC29A1Q99808 456 aa16.69■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms