RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 SPARTQ8N0X7 666 aa14.7□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 LRRC42Q9Y546 428 aa14.7□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 PAHP00439 452 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 TAF9Q16594 264 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 MPV17LQ2QL34 196 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 MIDNQ504T8 468 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 LDLRAD3Q86YD5 345 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 TMEM86BQ8N661 226 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 SUMF2Q8NBJ7 301 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 OR13D1Q8NGV5 346 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 SSMEM1Q8WWF3 244 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 CORO2AQ92828 525 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 BANF2Q9H503 90 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 IFT22Q9H7X7 185 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 SESN1Q9Y6P5 492 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 COL6A5A8TX70 2615 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 ARL6IP5O75915 188 aa14.68□□□□□ -0.06
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HERC3-205ENST00000426683 IGHV4-59P01825 116 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 KCNJ3P48549 501 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 C1orf100Q5SVJ3 147 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 ATAD3CQ5T2N8 411 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 UBE2UQ5VVX9 321 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 TMEM104Q8NE00 496 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 C17orf50Q8WW18 174 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 BARHL1Q9BZE3 327 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 TAS2R3Q9NYW6 316 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 OR6C3Q9NZP0 311 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 ZNRD1Q9P1U0 126 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 GHRLQ9UBU3 117 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 KIF25Q9UIL4 384 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 POMT1Q9Y6A1 747 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 MEIKINA0A087WXM9 373 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 MMP23AO75900 390 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 MGMTP16455 207 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 IER3P46695 156 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 LGALS4P56470 323 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 C16orf87Q6PH81 154 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 ZNF773Q6PK81 442 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 CHIAQ9BZP6 476 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 SELENOIQ9C0D9 397 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 NDUFB11Q9NX14 153 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 TMEM89A2RUT3 159 aa14.66□□□□□ -0.06
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HERC3-205ENST00000426683 UBBP0CG47 229 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 CALRP27797 417 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
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HERC3-205ENST00000426683 FCGR1BQ92637 280 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 FAM46BQ96A09 425 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 AJUBAQ96IF1 538 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 CST11Q9H112 138 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 TMEM133Q9H2Q1 129 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 DPAGT1Q9H3H5 408 aa14.66□□□□□ -0.06
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HERC3-205ENST00000426683 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
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HERC3-205ENST00000426683 CD37P11049 281 aa14.65□□□□□ -0.06
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HERC3-205ENST00000426683 CDK2P24941 298 aa14.65□□□□□ -0.06
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HERC3-205ENST00000426683 C17orf58Q2M2W7 97 aa14.65□□□□□ -0.06
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HERC3-205ENST00000426683 OR6M1Q8NGM8 313 aa14.65□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 OR13A1Q8NGR1 328 aa14.65□□□□□ -0.06
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HERC3-205ENST00000426683 Q96M66 194 aa14.65□□□□□ -0.06
HERC3-205ENST00000426683 GFI1Q99684 422 aa14.65□□□□□ -0.06
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HERC3-205ENST00000426683 BTBD17A6NE02 478 aa14.64□□□□□ -0.07
HERC3-205ENST00000426683 FAM181BA6NEQ2 426 aa14.64□□□□□ -0.07
HERC3-205ENST00000426683 SLC22A1O15245 554 aa14.64□□□□□ -0.07
HERC3-205ENST00000426683 RRP9O43818 475 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HERC3-205ENST00000426683 MPIG6BO95866 241 aa14.64□□□□□ -0.07
HERC3-205ENST00000426683 VSIG8P0DPA2 414 aa14.64□□□□□ -0.07
HERC3-205ENST00000426683 PAX6P26367 422 aa14.64□□□□□ -0.07
HERC3-205ENST00000426683 GDNFP39905 211 aa14.64□□□□□ -0.07
HERC3-205ENST00000426683 KCTD21Q4G0X4 260 aa14.64□□□□□ -0.07
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