RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 SRD5A2P31213 254 aa16.08■□□□□ 0.16
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SH3BP1-202ENST00000417536 OR10D3Q8NH80 312 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 BOD1Q96IK1 185 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNJ16Q9NPI9 418 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 IL36GQ9NZH8 169 aa16.08■□□□□ 0.16
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SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1W2PR64 198 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1W2PRV1 198 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF806P0C7X5 589 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.16
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SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa16.08■□□□□ 0.16
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SH3BP1-202ENST00000417536 GPR35Q9HC97 309 aa16.07■□□□□ 0.16
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SH3BP1-202ENST00000417536 EXTL1Q92935 676 aa16.06■□□□□ 0.16
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SH3BP1-202ENST00000417536 SULT1A1P50225 295 aa16.05■□□□□ 0.16
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SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF695Q8IW36 515 aa16.05■□□□□ 0.16
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SH3BP1-202ENST00000417536 CDRT15L2A8MXV6 281 aa16.05■□□□□ 0.16
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SH3BP1-202ENST00000417536 AGAP20933 346 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 CLDN15P56746 228 aa16.05■□□□□ 0.16
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SH3BP1-202ENST00000417536 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
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SH3BP1-202ENST00000417536 SLAMF9Q96A28 289 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 SGCZQ96LD1 299 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB5AP20339 215 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 BCL3P20749 454 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 LMO1P25800 156 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP6V0CP27449 155 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 CCL20P78556 96 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAM5Q6NVV9 412 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 HS3ST6Q96QI5 342 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 SPINK14Q6IE38 97 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 TUBA4BQ9H853 241 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 FREM1Q5H8C1 2179 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC01387J3KSC0 135 aa16.04■□□□□ 0.16
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