RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 OR1F12Q8NHA8 337 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 LRRC29Q8WV35 223 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 TMEM37Q8WXS4 190 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 HIPK2Q9H2X6 1198 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 TXNIPQ9H3M7 391 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 POLE4Q9NR33 117 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 HYDINQ4G0P3 5121 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 A0A087WZ39 114 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 TRAPPC13A5PLN9 417 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 PRORSD1PA6NEY8 169 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 OR6C6A6NF89 314 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 GGT3PA6NGU5 568 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 F5H5K5 113 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 H3BTX0 84 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 M0R1W7 72 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 ACOT8O14734 319 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 SLC22A2O15244 555 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 RIPK2O43353 540 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 TPST2O60704 377 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 SPAG7O75391 227 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 SERPINB7O75635 380 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 OR7A10O76100 309 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 TFF1P04155 84 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 ASAH2BP0C7U1 165 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 GLRA1P23415 457 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 IL12AP29459 219 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 PRDX6P30041 224 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 GGT2P36268 569 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 GABRA2P47869 451 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 RPL27P61353 136 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 AQP6Q13520 282 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 RIPK1Q13546 671 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 RGNQ15493 299 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 SSX2Q16385 188 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 AANATQ16613 207 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 PCK2Q16822 640 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 REEP3Q6NUK4 255 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF613Q6PF04 617 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 SPSB3Q6PJ21 355 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 C10orf99Q6UWK7 81 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 PGAP1Q75T13 922 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 MKXQ8IYA7 352 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 GVQW1Q8N7I0 195 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 POC1AQ8NBT0 407 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 CCDC197Q8NCU1 140 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 OR52M1Q8NGK5 317 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 OR8S1Q8NH09 359 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 PFN4Q8NHR9 129 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 TCP10LQ8TDR4 215 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 GATAD1Q8WUU5 269 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 TNFRSF14Q92956 283 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 SEH1LQ96EE3 360 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 SGTBQ96EQ0 304 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 ITCHQ96J02 903 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 DUX3Q96PT4 197 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 WFDC6Q9BQY6 131 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 ALG12Q9BV10 488 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 BCL2L10Q9HD36 194 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 KAAG1Q9UBP8 84 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF391Q9UJN7 358 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 RABL2BQ9UNT1 228 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 TCF19Q9Y242 345 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 FAM172BPA6NC97 362 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 A6NDX4 124 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 MSGN1A6NI15 193 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 SNURFLB1AK76 121 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 RER1O15258 196 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 GMDSO60547 372 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 KRT36O76013 467 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 ARG1P05089 322 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 IL6P05231 212 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 FCER2P06734 321 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 T-ENOLP0DO92 83 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 PRDX2P32119 198 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 FHITP49789 147 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 OR12D2P58182 307 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 CBX1P83916 185 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 CDK6Q00534 326 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 FADDQ13158 208 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-210ENST00000415055 HAGHQ16775 308 aa3.54□□□□□ -1.84
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