RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407117.6

ANKRD54-203, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-203ENST00000407117 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
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ANKRD54-203ENST00000407117 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF286AQ9HBT8 521 aa22.29■■□□□ 1.16
ANKRD54-203ENST00000407117 TMEM138Q9NPI0 162 aa22.29■■□□□ 1.16
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ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF281Q9Y2X9 895 aa22.29■■□□□ 1.16
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ANKRD54-203ENST00000407117 PRRX1P54821 245 aa22.28■■□□□ 1.16
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ANKRD54-203ENST00000407117 HLA-DRB5Q30154 266 aa22.28■■□□□ 1.16
ANKRD54-203ENST00000407117 WNT10AQ9GZT5 417 aa22.28■■□□□ 1.16
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ANKRD54-203ENST00000407117 LRRC36Q1X8D7 754 aa22.27■■□□□ 1.16
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ANKRD54-203ENST00000407117 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
ANKRD54-203ENST00000407117 TMEM80Q96HE8 168 aa22.27■■□□□ 1.16
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ANKRD54-203ENST00000407117 IL36GQ9NZH8 169 aa22.27■■□□□ 1.16
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ANKRD54-203ENST00000407117 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa22.27■■□□□ 1.15
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ANKRD54-203ENST00000407117 BLCAPP62952 87 aa22.26■■□□□ 1.15
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ANKRD54-203ENST00000407117 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
ANKRD54-203ENST00000407117 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
ANKRD54-203ENST00000407117 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa22.26■■□□□ 1.15
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ANKRD54-203ENST00000407117 METTL9Q9H1A3 318 aa22.25■■□□□ 1.15
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ANKRD54-203ENST00000407117 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
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ANKRD54-203ENST00000407117 CSTBP04080 98 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
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ANKRD54-203ENST00000407117 YIF1BQ5BJH7 314 aa22.23■■□□□ 1.15
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ANKRD54-203ENST00000407117 Q6ZS46 218 aa22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54-203ENST00000407117 LINC00596Q86U02 117 aa22.23■■□□□ 1.15
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ANKRD54-203ENST00000407117 MMP28Q9H239 520 aa22.23■■□□□ 1.15
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ANKRD54-203ENST00000407117 CKLFQ9UBR5 152 aa22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54-203ENST00000407117 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54-203ENST00000407117 GPX5O75715 221 aa22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54-203ENST00000407117 OR2F2O95006 317 aa22.22■■□□□ 1.15
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ANKRD54-203ENST00000407117 RCN1Q15293 331 aa22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54-203ENST00000407117 Q499Y3 187 aa22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54-203ENST00000407117 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa22.22■■□□□ 1.15
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