RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377027.1

C9orf85-202, Transcript of chromosome 9 open reading frame 85, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf85, Length 539 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85-202ENST00000377027 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 ABCA11PQ4W5N1 156 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 SPIN3Q5JUX0 258 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 LCE4AQ5TA78 99 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 HEPN1Q6WQI6 88 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 CCDC121Q6ZUS5 278 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 ABHD12Q8N2K0 398 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 STPG3Q8N7X2 389 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 OR5D18Q8NGL1 313 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 BCAS4Q8TDM0 211 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 PP6455Q8WZ26 134 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 SGCDQ92629 289 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 MYDGFQ969H8 173 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 FGGYQ96C11 551 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 C10orf35Q96D05 121 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 PELI1Q96FA3 418 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 ZNF649Q9BS31 505 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 SLC25A33Q9BSK2 321 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 OSBPL10Q9BXB5 764 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 RIBC2Q9H4K1 309 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 GNG8Q9UK08 70 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 A0A087X0M5 115 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 A0A1B0GX30 115 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 ODAMA1E959 279 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 FAM90A18PA6NE21 464 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 FAM90A16PA6NEW6 464 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 C9orf118A6NHY6 69 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 SAC3D1A6NKF1 404 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 OR4C45A6NMZ5 311 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 FAM90A12PA8MX19 464 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 MPIG6BO95866 241 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 ISG15P05161 165 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 FAM90A15PP0C7V4 464 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 FAM90A13PP0C7W8 464 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 FAM90A14PP0C7W9 464 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 FAM90A24PP0C7X0 464 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 FASP25445 335 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 ATP1B3P54709 279 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 MTCP1P56278 107 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 IL18R1Q13478 541 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 HLA-DRB5Q30154 266 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 Q8IYB0 196 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 CCDC54Q8NEL0 328 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 OR8J1Q8NGP2 316 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 OR13C9Q8NGT0 318 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 OPALINQ96PE5 141 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 DPM3Q9P2X0 92 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 AP4S1Q9Y587 144 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 A0A1W2PPI3 338 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 E9PI62 339 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 OR2F2O95006 317 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 MT-ND2P03891 347 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 CSN2P05814 226 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 GABRB1P18505 474 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 TMED1Q13445 227 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 TMEM244Q5VVB8 128 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 C16orf82Q7Z2V1 217 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 ENTHD1Q8IYW4 607 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 OR13A1Q8NGR1 328 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 LEAP2Q969E1 77 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 SPSB1Q96BD6 273 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 RNFT2Q96EX2 444 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 CYYR1Q96J86 154 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 TAS2R3Q9NYW6 316 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 MYRFQ9Y2G1 1151 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 CSMD3Q7Z407 3707 aa7.53□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa7.53□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 TRAV24A0A0B4J272 114 aa7.53□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.53□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa7.53□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 H3BNX3 289 aa7.53□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 SLC16A6O15403 523 aa7.53□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 IGHV3-7P01780 117 aa7.53□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 ALPLP05186 524 aa7.53□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 CCR9P51686 369 aa7.53□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 CDC42P60953 191 aa7.53□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 SLC25A30Q5SVS4 291 aa7.53□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa7.53□□□□□ -1.2
C9orf85-202ENST00000377027 RTN4RL2Q86UN3 420 aa7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms