RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
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CCDC42-201ENST00000293845 EFNB2P52799 333 aa10.91□□□□□ -0.66
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CCDC42-201ENST00000293845 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa10.9□□□□□ -0.67
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CCDC42-201ENST00000293845 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
CCDC42-201ENST00000293845 NDUFA13Q9P0J0 144 aa10.89□□□□□ -0.67
CCDC42-201ENST00000293845 KIF25Q9UIL4 384 aa10.89□□□□□ -0.67
CCDC42-201ENST00000293845 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
CCDC42-201ENST00000293845 AUP1Q9Y679 476 aa10.89□□□□□ -0.67
CCDC42-201ENST00000293845 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa10.88□□□□□ -0.67
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