RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 ADGRL4Q9HBW9 690 aa12.79□□□□□ -0.36
SPCS1-201ENST00000233025 GPR173Q9NS66 373 aa12.79□□□□□ -0.36
SPCS1-201ENST00000233025 C19orf73Q9NVV2 129 aa12.79□□□□□ -0.36
SPCS1-201ENST00000233025 K7N7A8 449 aa12.78□□□□□ -0.36
SPCS1-201ENST00000233025 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
SPCS1-201ENST00000233025 CRHBPP24387 322 aa12.78□□□□□ -0.36
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGDIBP52566 201 aa12.78□□□□□ -0.36
SPCS1-201ENST00000233025 ERVK11-1P61568 191 aa12.78□□□□□ -0.36
SPCS1-201ENST00000233025 CLVS2Q5SYC1 327 aa12.78□□□□□ -0.36
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF773Q6PK81 442 aa12.78□□□□□ -0.36
SPCS1-201ENST00000233025 SLC35F2Q8IXU6 374 aa12.78□□□□□ -0.36
SPCS1-201ENST00000233025 ELMOD2Q8IZ81 293 aa12.78□□□□□ -0.36
SPCS1-201ENST00000233025 C5orf56Q8N8D9 126 aa12.78□□□□□ -0.36
SPCS1-201ENST00000233025 CNIH3Q8TBE1 160 aa12.78□□□□□ -0.36
SPCS1-201ENST00000233025 FBLIM1Q8WUP2 373 aa12.78□□□□□ -0.36
SPCS1-201ENST00000233025 C4orf3Q8WVX3 66 aa12.78□□□□□ -0.36
SPCS1-201ENST00000233025 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
SPCS1-201ENST00000233025 R4GMQ9 66 aa12.78□□□□□ -0.36
SPCS1-201ENST00000233025 VPS13DQ5THJ4 4388 aa12.77□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC160A6NGH7 325 aa12.77□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 ZAR1LA6NP61 321 aa12.77□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 A8MZ25 164 aa12.77□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 SLC25A17O43808 307 aa12.77□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 LY6G6CO95867 125 aa12.77□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 IGHG2P01859 326 aa12.77□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 TFAP2AP05549 437 aa12.77□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 CCL1P22362 96 aa12.77□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 BDH1Q02338 343 aa12.77□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 BCL2L15Q5TBC7 163 aa12.77□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 ASPHD1Q5U4P2 390 aa12.77□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 SLX4IPQ5VYV7 408 aa12.77□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 NXNL2Q5VZ03 156 aa12.77□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 C12orf73Q69YU5 71 aa12.77□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 SSX6Q7RTT6 188 aa12.77□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 GPR141Q7Z602 305 aa12.77□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF573Q86YE8 665 aa12.77□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 BATF2Q8N1L9 274 aa12.77□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa12.77□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 TCEANCQ8N8B7 351 aa12.77□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 Q96MT0 163 aa12.77□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 CLN6Q9NWW5 311 aa12.77□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 OR52A1Q9UKL2 312 aa12.77□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa12.77□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 A6NIN4 97 aa12.76□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 DHRS7CA6NNS2 312 aa12.76□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF737O75373 536 aa12.76□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 MMP23AO75900 390 aa12.76□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 NXPH2O95156 264 aa12.76□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 MTNR1BP49286 362 aa12.76□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 EDDM3BP56851 147 aa12.76□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP12.76□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 SLC35E3Q7Z769 313 aa12.76□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 ENTHD1Q8IYW4 607 aa12.76□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 SVOPQ8N4V2 548 aa12.76□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM163Q8TC26 289 aa12.76□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 MNTQ99583 582 aa12.76□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC90BQ9GZT6 254 aa12.76□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa12.76□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 SLC22A13Q9Y226 551 aa12.76□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 PTGES3LE9PB15 166 aa12.75□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 IGLV1-47P01700 117 aa12.75□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 FOXE3Q13461 319 aa12.75□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa12.75□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa12.75□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 ANGPTL5Q86XS5 388 aa12.75□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 FOXRED2Q8IWF2 684 aa12.75□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 OR11H1Q8NG94 326 aa12.75□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 RHOXF1Q8NHV9 184 aa12.75□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 OR14J1Q9UGF5 321 aa12.75□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 DNAH6Q9C0G6 4158 aa12.75□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa12.74□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 FAM90A18PA6NE21 464 aa12.74□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 FAM90A16PA6NEW6 464 aa12.74□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa12.74□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 LINC01548A6NM66 108 aa12.74□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa12.74□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 FAM90A12PA8MX19 464 aa12.74□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa12.74□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 LEUTXA8MZ59 168 aa12.74□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa12.74□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 F8VVB4 439 aa12.74□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 F8VWA3 439 aa12.74□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 RGS10O43665 173 aa12.74□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 NOL3O60936 208 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 IFNA6P05013 189 aa12.74□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 FAM90A15PP0C7V4 464 aa12.74□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 FAM90A13PP0C7W8 464 aa12.74□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 FAM90A14PP0C7W9 464 aa12.74□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 FAM90A24PP0C7X0 464 aa12.74□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 ALDH3B2P48448 385 aa12.74□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 IL24Q13007 206 aa12.74□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 Q8N1Y9 231 aa12.74□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
SPCS1-201ENST00000233025 PKIBQ9C010 78 aa12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms