RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000173740.1

Lgr5-208, Transcript of Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mouse

TSL 5 BASIC

Gene Lgr5, Length 2,508 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr1234	A2AVK5	314 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Akirin2	B1AXD8	201 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr199	F6ZUS0	308 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gm11009	F7CWA7	138 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Vmn2r29	L7N2D4	852 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Aqp7	O54794	303 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Hprt1	P00493	218 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Egr1	P08046	533 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Igsf6	P0C6B7	237 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Tpbpa	P13438	124 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Fkbp2	P45878	140 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Anxa7	Q07076	463 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr5	Q60889	312 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr506	Q7TRU6	314 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Plppr1	Q8BFZ2	325 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Zfp747	Q8BHM7	422 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Foxj3	Q8BUR3	623 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Sowahb	Q8BZW2	760 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Lrrn3	Q8CBC6	707 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Bivm	Q8CBX9	502 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ccnq	Q8QZR8	250 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Crtac1	Q8R555	646 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Chrdl2	Q8VEA6	426 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr446	Q8VEV0	308 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr593	Q8VF28	327 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr639	Q8VGY8	316 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Exosc4	Q921I9	245 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Mrps16	Q9CPX7	135 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Reg4	Q9D8G5	157 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	9530002B09Rik	Q9EPV7	135 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr948	Q9EQ95	321 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Yipf7	Q9JIM5	254 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Adh4	Q9QYY9	377 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Mvk	Q9R008	395 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Slc7a11	Q9WTR6	502 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Bpnt1	Q9Z0S1	308 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gm13078	A2AGW8	474 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr1018	A2ASV3	311 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr1314	A2AVL6	312 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Mllt6	B1AR10	1109 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Hsd11b1	P50172	292 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ctdspl	P58465	276 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Smad5	P97454	465 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Fabp5	Q05816	135 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Thsd4	Q3UTY6	1018 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Dyrk1a	Q61214	763 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Klhl9	Q6ZPT1	617 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Adam20	Q7M763	760 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Fmr1nb	Q80ZA7	238 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ifna16	Q810G1	189 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Kbtbd11	Q8BNW9	633 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Tigar	Q8BZA9	269 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr1100	Q8VFM1	321 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr768	Q8VGC4	312 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Hrh4	Q91ZY2	391 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Acaa1a	Q921H8	424 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Aspn	Q99MQ4	373 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Mpped2	Q9CZJ0	294 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Galnt16	Q9JJ61	558 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gab2	Q9Z1S8	665 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Kmt2b	O08550	2713 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr1029	A2ATE0	324 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Msmp	B1AWI6	139 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	4933403O08Rik	F6UK53	379 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	P2rx6	O54803	389 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Nodal	P43021	354 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Rac3	P60764	192 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Mbd3l2	Q3UXB0	228 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Hist2h2ab	Q64522	130 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	St6gal1	Q64685	403 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Tas2r143	Q7TQB9	293 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr1219	Q7TR04	311 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr1168	Q7TR25	312 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr1058	Q7TR74	316 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr1028	Q7TR89	324 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Or51e2	Q8VBV9	320 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Dkk4	Q8VEJ3	221 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gtf3a	Q8VHT7	364 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740		Q91WE4	72 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gpnmb	Q99P91	574 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Utp23	Q9CX11	249 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Rnf128	Q9D304	428 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Vmn1r172	Q9EPS4	313 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Hsd17b6	Q9R092	317 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Vamp5	Q9Z2P8	102 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Itpr1	P11881	2749 aa		10.12	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Pom121l12	A0A1B0GSJ4	278 aa		10.11	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Rhox7b	A6PW38	321 aa		10.11	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr585	E9PXW4	318 aa		10.11	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Slc28a2	O88627	660 aa		10.11	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Hoxa5	P09021	270 aa		10.11	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Hoxb5	P09079	269 aa		10.11	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Hsd17b8	P50171	259 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Arl11	Q6P3A9	176 aa		10.11	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Rgs13	Q8K443	158 aa		10.11	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr518	Q8VEW1	333 aa		10.11	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr434	Q8VF17	321 aa		10.11	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr1280	Q8VGG8	305 aa		10.11	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Fam210b	Q9D8B6	190 aa		10.11	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ceacam13	Q9DAT7	263 aa		10.11	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.7 ms