RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020258.9

Herc4-201, Transcript of Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc4, Length 3,898 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4-201ENSMUST00000020258 Nxph2Q61199 261 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Igsf21Q7TNR6 468 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1450Q8VF19 325 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1377Q8VGH1 307 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr796Q8VGJ1 310 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Nudt16l1Q8VHN8 211 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rnf141Q99MB7 230 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fbxo36Q9CQ24 188 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Arrdc2Q9D668 407 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Decr2Q9WV68 292 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 FrylF8VQ05 3007 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm7697A0A0J9YUH2 350 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm9495A0A0J9YUZ3 350 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm14444A2ARW3 426 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr225E9PWF9 419 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 C1ql1O88992 258 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Igh-1aP01865 398 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Lbx1P52955 282 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Dok1P97465 482 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Q3U6N9 222 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rsl1Q7M6Y1 485 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr32Q7TQZ0 308 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr24Q8VFM9 313 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr50Q8VGK5 312 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Dnttip1Q99LB0 328 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Borcs8Q9D6Y4 120 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 SmpxQ9DC77 85 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gnpnat1Q9JK38 184 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rev3lQ61493 3122 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm13723A0A1L1SUP2 315 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr69E9Q7C5 316 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm20834J3QM72 227 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Itln1O88310 313 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Il4P07750 140 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 ElnP54320 860 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Wbp1P97764 304 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mrpl22Q8BU88 206 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc38a2Q8CFE6 504 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr401Q8VFX6 315 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Lpcat3Q91V01 487 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Nmnat3Q99JR6 245 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Elp5Q99L85 300 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 NubplQ9CWD8 319 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Hint2Q9D0S9 163 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Vmn1r40Q9EQ46 310 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr887Q9EQA6 309 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Wnk2Q3UH66 2149 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Dock9Q8BIK4 2055 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1532-ps1A0A0R4J8U2 307 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm11361A0A1Y7VKY1 152 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ceacam16E9QA28 426 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr707K7N662 307 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Sult2a4L7N245 285 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 GlulP15105 373 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cbr1P48758 277 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Defa11P50709 85 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tcl1aP56280 116 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rps18P62270 152 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cuzd1P70412 606 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rasl2-9Q61820 216 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cnot4Q8BT14 575 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Actrt3Q8BXF8 369 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Znf385aQ8VD12 386 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 NmbQ9CR53 121 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Zfand6Q9DCH6 223 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Znf319Q9ERR8 581 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ccnl2Q9JJA7 518 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Nup210Q9QY81 1886 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm10037E9PX85 104 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cbfa2t3O54972 620 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 MosP00536 390 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 P01654 111 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 P01656 111 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 P03977 111 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Klk1b26P36369 261 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pate2Q3UW31 111 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Usf2Q64705 346 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr901Q7TRD1 311 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ctrb1Q9CR35 263 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Q9CWB7 115 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Angpt4Q9WVH6 509 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm17655A0A1B0GT13 591 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm12790B1AUV6 201 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rhox3gB9EJQ9 160 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 4930467E23RikD3Z1P8 350 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm15319E9Q637 350 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm5039J3QNT6 144 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm5225J3QPL3 108 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Wsb1O54927 421 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rab3dP35276 219 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Efnb2P52800 336 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm2016Q3TQZ4 144 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Klf2Q60843 354 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 GgnQ80WJ1 673 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm5662Q8BX20 144 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fbxw19Q8C2W8 466 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm21119Q8C646 350 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Hsd17b13Q8VCR2 304 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Zfp982A2A8Q4 368 aa10.12□□□□□ -0.79
Herc4-201ENSMUST00000020258 Zfp942B8JJA7 486 aa10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.3 ms