RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636350.1

CACNB4-222, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4, human

TSL 5 BASIC

Gene CACNB4, Length 7,654 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNB4-222	ENST00000636350	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	CPLX1	O14810	134 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	ZEB2	O60315	1214 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	CIAO1	O76071	339 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	EVC	P57679	992 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	FERMT2	Q96AC1	680 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	HACD3	Q9P035	362 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	SWAP70	Q9UH65	585 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	MTMR6	Q9Y217	621 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	RPS6KB1	P23443	525 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	GJB2	P29033	226 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	CDK17	Q00537	523 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	MAP3K12	Q12852	859 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	MAP4K1	Q92918	833 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	FAM210A	Q96ND0	272 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	ATP6V1A	P38606	617 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	MMP14	P50281	582 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	FLII	Q13045	1269 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	EMB	Q6PCB8	327 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	UTY	O14607	1347 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	BICDL2	A1A5D9	508 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	LAD1	O00515	517 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	GFPT2	O94808	682 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	CCDC172	P0C7W6	258 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	FSD1	Q9BTV5	496 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	CDK19	Q9BWU1	502 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	SLIT3	O75094	1523 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350		E7ENQ6	273 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	ATP5J	P18859	108 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	USP5	P45974	858 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	EBAG9	O00559	213 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	RLBP1	P12271	317 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	ATP5D	P30049	168 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	SEPT2	Q15019	361 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	NEUROD2	Q15784	382 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	ICE2	Q659A1	982 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	RAI14	Q9P0K7	980 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	POLK	Q9UBT6	870 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	TULP2	O00295	520 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	PRLR	P16471	622 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	KSR2	Q6VAB6	950 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	SDF4	Q9BRK5	362 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	USP6	P35125	1406 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	KIF2C	Q99661	725 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	KRT23	Q9C075	422 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	CES2	O00748	559 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	PRC1	O43663	620 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	GHR	P10912	638 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	WDR93	Q6P2C0	686 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CACNB4-222	ENST00000636350	NEK1	Q96PY6	1258 aa		3.76	□□□□□ -1.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms