RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623635.1

PTPRQ-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, human

TSL 5

Gene PTPRQ, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRQ-210	ENST00000623635	GIPC2	Q8TF65	315 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	ADAM11	O75078	769 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	COL19A1	Q14993	1142 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	CITED4	Q96RK1	184 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635		A0A1W2PP55	124 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635		F8W735	103 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635		H3BRJ5	948 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	TP53INP1	Q96A56	240 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	PDE3B	Q13370	1112 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	DYRK3	O43781	588 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	BSND	Q8WZ55	320 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	FAM177B	A6PVY3	158 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	CABP4	P57796	275 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	TMC7	Q7Z402	723 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRQ-210	ENST00000623635	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	TCF12	Q99081	682 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	NPHS2	Q9NP85	383 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	VAMP1	P23763	118 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	GRIA4	P48058	902 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	NLRP12	P59046	1061 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	PIP4K2B	P78356	416 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	ACAD11	Q709F0	780 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	CCNJL	Q8IV13	435 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	NEFL	P07196	543 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	IKBKE	Q14164	716 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	CSRNP1	Q96S65	589 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	GLB1	P16278	677 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	XP32	Q5T750	250 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635		Q6ZS46	218 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	WNT8B	Q93098	351 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635		A0A096LPE4	126 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635		A0A1W2PPZ6	126 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
PTPRQ-210	ENST00000623635	TREH	O43280	583 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PTPRQ-210	ENST00000623635	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PTPRQ-210	ENST00000623635	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PTPRQ-210	ENST00000623635	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
PTPRQ-210	ENST00000623635	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PTPRQ-210	ENST00000623635	PI16	Q6UXB8	463 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PTPRQ-210	ENST00000623635	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PTPRQ-210	ENST00000623635	EHD4	Q9H223	541 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PTPRQ-210	ENST00000623635	IGSF3	O75054	1194 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PTPRQ-210	ENST00000623635	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
PTPRQ-210	ENST00000623635	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	10.32	□□□□□ -0.76
PTPRQ-210	ENST00000623635	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PTPRQ-210	ENST00000623635	ARL4D	P49703	201 aa		10.31	□□□□□ -0.76
PTPRQ-210	ENST00000623635	DSC3	Q14574	896 aa		10.31	□□□□□ -0.76
PTPRQ-210	ENST00000623635	DLGAP3	O95886	979 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PTPRQ-210	ENST00000623635	PCDH1	Q08174	1060 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PTPRQ-210	ENST00000623635	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
PTPRQ-210	ENST00000623635	PLCB3	Q01970	1234 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PTPRQ-210	ENST00000623635	GSTM4	Q03013	218 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PTPRQ-210	ENST00000623635	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PTPRQ-210	ENST00000623635	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PTPRQ-210	ENST00000623635	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PTPRQ-210	ENST00000623635	USP26	Q9BXU7	913 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PTPRQ-210	ENST00000623635	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
PTPRQ-210	ENST00000623635	ABCB6	Q9NP58	842 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PTPRQ-210	ENST00000623635	RECK	O95980	971 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PTPRQ-210	ENST00000623635	TCF3	P15923	654 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PTPRQ-210	ENST00000623635	GRM2	Q14416	872 aa		10.28	□□□□□ -0.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms