RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 KLRK1P26718 216 aa27.93■■■□□ 2.06
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SRRT-218ENST00000620394 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
SRRT-218ENST00000620394 EPHA10Q5JZY3 1008 aa27.92■■■□□ 2.06
SRRT-218ENST00000620394 LDLRAD1Q5T700 205 aa27.92■■■□□ 2.06
SRRT-218ENST00000620394 TTLL5Q6EMB2 1281 aa27.92■■■□□ 2.06
SRRT-218ENST00000620394 KIAA0825Q8IV33 1275 aa27.92■■■□□ 2.06
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SRRT-218ENST00000620394 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
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SRRT-218ENST00000620394 SLFN5Q08AF3 891 aa27.84■■■□□ 2.05
SRRT-218ENST00000620394 MTMR14Q8NCE2 650 aa27.84■■■□□ 2.05
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SRRT-218ENST00000620394 SUCLG2Q96I99 432 aa27.83■■■□□ 2.05
SRRT-218ENST00000620394 WNK4Q96J92 1243 aa27.83■■■□□ 2.05
SRRT-218ENST00000620394 ARAP2Q8WZ64 1704 aa27.83■■■□□ 2.05
SRRT-218ENST00000620394 OTOP1Q7RTM1 612 aa27.82■■■□□ 2.04
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SRRT-218ENST00000620394 ERO1AQ96HE7 468 aa27.8■■■□□ 2.04
SRRT-218ENST00000620394 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP27.79■■■□□ 2.04
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SRRT-218ENST00000620394 CLMNQ96JQ2 1002 aa27.79■■■□□ 2.04
SRRT-218ENST00000620394 CNNM1Q9NRU3 951 aa27.79■■■□□ 2.04
SRRT-218ENST00000620394 HTTP42858 3142 aa27.78■■■□□ 2.04
SRRT-218ENST00000620394 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa27.78■■■□□ 2.04
SRRT-218ENST00000620394 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
SRRT-218ENST00000620394 SPDYE2BA6NHP3 402 aa27.77■■■□□ 2.04
SRRT-218ENST00000620394 SPDYE6P0CI01 402 aa27.77■■■□□ 2.04
SRRT-218ENST00000620394 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
SRRT-218ENST00000620394 ALDH1L2Q3SY69 923 aa27.77■■■□□ 2.04
SRRT-218ENST00000620394 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa27.77■■■□□ 2.04
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SRRT-218ENST00000620394 POTEFA5A3E0 1075 aa27.75■■■□□ 2.03
SRRT-218ENST00000620394 CCER2I3L3R5 266 aa27.75■■■□□ 2.03
SRRT-218ENST00000620394 UBE4AQ14139 1066 aa27.75■■■□□ 2.03
SRRT-218ENST00000620394 CFAP100Q494V2 611 aa27.75■■■□□ 2.03
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SRRT-218ENST00000620394 CRHR2Q13324 411 aa27.74■■■□□ 2.03
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SRRT-218ENST00000620394 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa27.74■■■□□ 2.03
SRRT-218ENST00000620394 F8W031 263 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
SRRT-218ENST00000620394 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa27.73■■■□□ 2.03
SRRT-218ENST00000620394 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
SRRT-218ENST00000620394 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa27.73■■■□□ 2.03
SRRT-218ENST00000620394 MROH5Q6ZUA9 1318 aa27.72■■■□□ 2.03
SRRT-218ENST00000620394 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
SRRT-218ENST00000620394 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
SRRT-218ENST00000620394 CD99L2Q8TCZ2 262 aa27.72■■■□□ 2.03
SRRT-218ENST00000620394 ARMC5Q96C12 935 aa27.72■■■□□ 2.03
SRRT-218ENST00000620394 FAM205AQ6ZU69 1335 aa27.71■■■□□ 2.03
SRRT-218ENST00000620394 PLIN1O60240 522 aa27.71■■■□□ 2.03
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