RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600058.5

FCHO1-230, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 2

Gene FCHO1, Length 910 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-230ENST00000600058 CERS5Q8N5B7 392 aa21.64■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 A0A1B0GUL6 1792 aa21.64■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.63■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 GCKRQ14397 625 aa21.63■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 G2E3Q7L622 706 aa21.63■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 ERO1AQ96HE7 468 aa21.63■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 POTEFA5A3E0 1075 aa21.62■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 CASP7P55210 303 aa21.62■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa21.62■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.61■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 MYO1BO43795 1136 aa21.61■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 SPDYE6P0CI01 402 aa21.61■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 PTPN22Q9Y2R2 807 aa21.61■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 BRCA2P51587 3418 aa21.6■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 CACNA1FO60840 1977 aa21.6■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 CEP290O15078 2479 aa21.6■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 SLC4A2P04920 1241 aa21.6■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 CFAP100Q494V2 611 aa21.6■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.6■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.6■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa21.6■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 OTOFQ9HC10 1997 aa21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 CLRN2A0PK11 232 aa21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 SNAP23O00161 211 aa21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 IL1R1P14778 569 aa21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 IREB2P48200 963 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 CRHR2Q13324 411 aa21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 CD99L2Q8TCZ2 262 aa21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.58■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 TAF5LO75529 589 aa21.58■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 GJA5P36382 358 aa21.58■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF804AQ7Z570 1209 aa21.58■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 ARMC5Q96C12 935 aa21.58■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 EFCC1Q9HA90 598 aa21.58■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 VEZTQ9HBM0 779 aa21.58■■□□□ 1.05
FCHO1-230ENST00000600058 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
FCHO1-230ENST00000600058 F8W031 263 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
FCHO1-230ENST00000600058 USP2O75604 605 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
FCHO1-230ENST00000600058 FLIIQ13045 1269 aa21.57■■□□□ 1.04
FCHO1-230ENST00000600058 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.57■■□□□ 1.04
FCHO1-230ENST00000600058 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
FCHO1-230ENST00000600058 LINS1Q8NG48 757 aa21.57■■□□□ 1.04
FCHO1-230ENST00000600058 SP3Q02447 781 aa21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-230ENST00000600058 DNAAF4Q8WXU2 420 aa21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-230ENST00000600058 PTPN18Q99952 460 aa21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-230ENST00000600058 AOX1Q06278 1338 aa21.55■■□□□ 1.04
FCHO1-230ENST00000600058 RASA3Q14644 834 aa21.55■■□□□ 1.04
FCHO1-230ENST00000600058 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
FCHO1-230ENST00000600058 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
FCHO1-230ENST00000600058 EN2P19622 333 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
FCHO1-230ENST00000600058 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
FCHO1-230ENST00000600058 FOXO4P98177 505 aa21.53■■□□□ 1.04
FCHO1-230ENST00000600058 CCDC27Q2M243 656 aa21.53■■□□□ 1.04
FCHO1-230ENST00000600058 CAP1Q01518 475 aa21.52■■□□□ 1.04
FCHO1-230ENST00000600058 TNFAIP1Q13829 316 aa21.52■■□□□ 1.04
FCHO1-230ENST00000600058 OPTNQ96CV9 577 aa21.52■■□□□ 1.04
FCHO1-230ENST00000600058 JAG2Q9Y219 1238 aa21.52■■□□□ 1.04
FCHO1-230ENST00000600058 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.52■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 SPDYE2Q495Y8 402 aa21.51■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 MS4A4AQ96JQ5 239 aa21.51■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 ELP3Q9H9T3 547 aa21.51■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.51■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 WWC1Q8IX03 1113 aa21.5■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF333Q96JL9 665 aa21.5■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 TMEM106CQ9BVX2 250 aa21.5■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.5■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 IL16Q14005 1332 aa21.5■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 ARHGEF6Q15052 776 aa21.49■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 SERPINA10Q9UK55 444 aa21.49■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa21.49■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.48■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 BRI3BPQ8WY22 251 aa21.48■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 TEPSINQ96N21 525 aa21.48■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.47■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 LMBR1LQ6UX01 489 aa21.47■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.47■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 NBPF11Q86T75 865 aa21.47■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa21.47■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa21.46■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 PLIN1O60240 522 aa21.46■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 GTF2A2P52657 109 aa21.46■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 CCL15Q16663 113 aa21.46■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa21.46■■□□□ 1.03
FCHO1-230ENST00000600058 BEND3Q5T5X7 828 aa21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms