RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597512.1

FCHO1-221, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FCHO1, Length 2,934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-221ENST00000597512 PDE6AP16499 860 aa16.37■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 BCAMP50895 628 aa16.37■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 ZNF532Q9HCE3 1301 aa16.37■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 STX6O43752 255 aa16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 ADRA2BP18089 450 aa16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 SYT1P21579 422 aa16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 TTLL5Q6EMB2 1281 aa16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 KRT27Q7Z3Y8 459 aa16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 A0A0G2JLW4 131 aa16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 MAP3K12Q12852 859 aa16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 UBE4AQ14139 1066 aa16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 KLHL40Q2TBA0 621 aa16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 WWC3Q9ULE0 1092 aa16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa16.35■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 FGAP02671 866 aa16.35■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 MINPP1Q9UNW1 487 aa16.35■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 CARMIL3Q8ND23 1372 aa16.35■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 FGD1P98174 961 aa16.35■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 SLC27A3Q5K4L6 730 aa16.35■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 ZNF804BA4D1E1 1349 aa16.34■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 NPHP1O15259 732 aa16.34■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 RPS8P62241 208 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 CHAMP1Q96JM3 812 aa16.34■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 STK3Q13188 491 aa16.33■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 BRF1Q92994 677 aa16.33■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 GTF3C6Q969F1 213 aa16.33■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 LRRC2Q9BYS8 371 aa16.33■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
FCHO1-221ENST00000597512 CCDC24Q8N4L8 307 aa16.33■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 MAGEB6Q8N7X4 407 aa16.33■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 AIDAQ96BJ3 306 aa16.33■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 AGXT2Q9BYV1 514 aa16.33■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 ZNF213O14771 459 aa16.32■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 NFIXQ14938 502 aa16.32■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 HAND2P61296 217 aa16.32■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 CAVIN4Q5BKX8 364 aa16.32■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 TCHHQ07283 1943 aa16.32■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 TRIM37O94972 964 aa16.32■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 F13A1P00488 732 aa16.32■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa16.32■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 MYH13Q9UKX3 1938 aa16.31■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 PDCP20941 246 aa16.31■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 GYG1P46976 350 aa16.31■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 ANKRD2Q9GZV1 360 aa16.31■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa16.31■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 MTMR6Q9Y217 621 aa16.31■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 APPP05067 770 aa16.3■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 TM4SF1P30408 202 aa16.3■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 FBXL16Q8N461 479 aa16.3■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 CNBD1Q8NA66 436 aa16.3■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 LRP2BPQ9P2M1 347 aa16.3■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 PFKFB2O60825 505 aa16.3■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 DTNBO60941 627 aa16.3■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 VPS37DQ86XT2 251 aa16.3■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 NCOA7Q8NI08 942 aa16.3■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 FSD2A1L4K1 749 aa16.29■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 ZMYM6O95789 1325 aa16.29■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 MBD4O95243 580 aa16.29■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 NCLP19338 710 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 APOBRQ0VD83 1088 aa16.29■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 CHD4Q14839 1912 aa16.29■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 MCM5P33992 734 aa16.29■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 SCRN1Q12765 414 aa16.29■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 ALX1Q15699 326 aa16.29■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 CHST3Q7LGC8 479 aa16.29■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 DENND2AQ9ULE3 1009 aa16.29■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 GPT2Q8TD30 523 aa16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 MBD3O95983 291 aa16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 GYS1P13807 737 aa16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 WDR19Q8NEZ3 1342 aa16.27■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 SEMA3EO15041 775 aa16.27■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 GNAT2P19087 354 aa16.27■□□□□ 0.2
FCHO1-221ENST00000597512 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.2 ms