RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPIP5K2	O43314	1243 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	C8orf34	Q49A92	452 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	FSD1	Q9BTV5	496 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576		G3V3G9	751 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDC45	O75419	566 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHGB	P05060	677 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	ABCF2	Q9UG63	623 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	ECE2	O60344	883 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	PODN	Q7Z5L7	613 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHD4	Q14839	1912 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	AK9	Q5TCS8	1911 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZBTB22	O15209	634 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	11.09	□□□□□ -0.63	9e-8	■■□□□ 11.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHML	P26374	656 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	RASSF7	Q02833	373 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	GTF2I	P78347	998 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	VPS33B	Q9H267	617 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	COL4A5	P29400	1685 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRELP	P51888	382 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	CASC1	Q6TDU7	716 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	FBXW7	Q969H0	707 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	BACH2	Q9BYV9	841 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	YDJC	A8MPS7	323 aa		11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRDX5	P30044	214 aa		11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM227B	Q96M60	508 aa		11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAP3K12	Q12852	859 aa		11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	11.07	□□□□□ -0.64	8e-7	■■■□□ 15.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	IL25	Q9H293	177 aa		11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	RAI14	Q9P0K7	980 aa		11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	SEC24B	O95487	1268 aa		11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	GRIK5	Q16478	980 aa		11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	NIM1K	Q8IY84	436 aa		11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	SCN9A	Q15858	1988 aa		11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A0D9SFI3	127 aa		11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	HIP1	O00291	1037 aa		11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	PDE6A	P16499	860 aa		11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	JDP2	Q8WYK2	163 aa		11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	MXD3	Q9BW11	206 aa		11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADD2	P35612	726 aa		11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	GPR162	Q16538	588 aa		11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	CERS5	Q8N5B7	392 aa		11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF384	Q8TF68	577 aa		11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	USP17L3	A6NCW0	530 aa		11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	USP17L4	A6NCW7	530 aa		11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	RAD17	O75943	681 aa		11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	TICAM2	Q86XR7	235 aa		11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	MECOM	Q03112	1051 aa		11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	DACT2	Q5SW24	774 aa		11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	OSBP2	Q969R2	916 aa		11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	DOCK2	Q92608	1830 aa		11.04	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		11.04	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	SGSM2	O43147	1006 aa		11.04	□□□□□ -0.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	UBE3C	Q15386	1083 aa		11.04	□□□□□ -0.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms