RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 ZBTB33Q86T24 672 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM87AQ8NBN3 555 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 NNTQ13423 1086 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 OXLD1Q5BKU9 147 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 C4orf48Q5BLP8 95 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 C9orf131Q5VYM1 1079 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 TMC4Q7Z404 712 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 TINF2Q9BSI4 451 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 OVOS2Q6IE36 1432 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 NRKQ7Z2Y5 1582 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 COL18A1P39060 1754 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 IL2RBP14784 551 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 ATP2B1P20020 1258 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 VARSP26640 1264 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 BAG6P46379 1132 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 KIF7Q2M1P5 1343 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 MORC1Q86VD1 984 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 RNF34Q969K3 372 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC7Q96M83 1385 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 ZFP42Q96MM3 310 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 NSD3Q9BZ95 1437 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 MRS2Q9HD23 443 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 BRPF3Q9ULD4 1205 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 NRAPQ86VF7 1730 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 TRIM37O94972 964 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 PLCB3Q01970 1234 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 MTMR3Q13615 1198 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 DSC3Q14574 896 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 DEFB132Q7Z7B7 95 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 DMRTB1Q96MA1 342 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 GMLQ99445 158 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 LNPKQ9C0E8 428 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 POLKQ9UBT6 870 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 BRWD3Q6RI45 1802 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 LMO7Q8WWI1 1683 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 NFAT5O94916 1531 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 WASHC2AQ641Q2 1341 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 SORBS3O60504 671 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 APBA3O96018 575 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 TIMP2P16035 220 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 DAB2P98082 770 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 NBPF6Q5VWK0 638 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 NBPF4Q96M43 638 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 MKNK1Q9BUB5 465 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 CCSER2Q9H7U1 834 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 PARP2Q9UGN5 583 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 KIF24Q5T7B8 1368 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 TLDC2A0PJX2 215 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 SOBPA7XYQ1 873 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 LDHBP07195 334 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 IGFBP4P22692 258 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 FANCCQ00597 558 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 SOGA3Q5TF21 947 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 RGPD5Q99666 1765 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 NR3C2P08235 984 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 MPNDQ8N594 471 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 KAT6BQ8WYB5 2073 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 INSRP06213 1382 aa10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 TATP17735 454 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 WDR4P57081 412 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 RBL2Q08999 1139 aa10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 ALKBH2Q6NS38 261 aa10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 CAPN12Q6ZSI9 719 aa10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 ZFAND3Q9H8U3 227 aa10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-216ENST00000590105 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP10.15□□□□□ -0.783e-11■■■■■ 99.4
EFTUD2-216ENST00000590105 USP54Q70EL1 1684 aa10.15□□□□□ -0.79
EFTUD2-216ENST00000590105 FLT4P35916 1363 aa10.14□□□□□ -0.79
EFTUD2-216ENST00000590105 ERBB4Q15303 1308 aa10.14□□□□□ -0.79
EFTUD2-216ENST00000590105 ABCC6O95255 1503 aa10.14□□□□□ -0.79
EFTUD2-216ENST00000590105 PLSCR1O15162 318 aa10.14□□□□□ -0.79
EFTUD2-216ENST00000590105 LORP23490 312 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
EFTUD2-216ENST00000590105 GMPRP36959 345 aa10.14□□□□□ -0.79
EFTUD2-216ENST00000590105 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
EFTUD2-216ENST00000590105 ARID5BQ14865 1188 aa10.14□□□□□ -0.79
EFTUD2-216ENST00000590105 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
EFTUD2-216ENST00000590105 GAS2L2Q8NHY3 880 aa10.14□□□□□ -0.79
EFTUD2-216ENST00000590105 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
EFTUD2-216ENST00000590105 CAMKK2Q96RR4 588 aa10.14□□□□□ -0.79
EFTUD2-216ENST00000590105 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
EFTUD2-216ENST00000590105 RTL1A6NKG5 1358 aa10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms