RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-211	ENST00000582232	DOK7	Q18PE1	504 aa		14.03	□□□□□ -0.16
GGA3-211	ENST00000582232	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		14.03	□□□□□ -0.16
GGA3-211	ENST00000582232	SPATA5	Q8NB90	893 aa		14.03	□□□□□ -0.16
GGA3-211	ENST00000582232	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	14.02	□□□□□ -0.16
GGA3-211	ENST00000582232	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		14.02	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232		G3V3G9	751 aa		14.02	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	IGSF3	O75054	1194 aa		14.02	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	RGS3	P49796	1198 aa		14.02	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	TTC22	Q5TAA0	569 aa		14.02	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		14.02	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	TICAM2	Q86XR7	235 aa		14.02	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	NIM1K	Q8IY84	436 aa		14.02	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	JDP2	Q8WYK2	163 aa		14.02	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		14.02	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		14.02	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		14.02	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	DOCK2	Q92608	1830 aa		14.01	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	YDJC	A8MPS7	323 aa		14.01	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		14.01	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		14.01	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		14.01	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	AK9	Q5TCS8	1911 aa		14	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	FZD9	O00144	591 aa		14	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	ZAP70	P43403	619 aa		14	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	PI16	Q6UXB8	463 aa		14	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		14	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		14	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	USP17L3	A6NCW0	530 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	USP17L4	A6NCW7	530 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	EVI5L	Q96CN4	794 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	SNRK	Q9NRH2	765 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	MYH7	P12883	1935 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	GTF2I	P78347	998 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	DACT2	Q5SW24	774 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	CNTROB	Q8N137	903 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	GOLIM4	O00461	696 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	YY1	P25490	414 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	CXCL9	Q07325	125 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	TNIP1	Q15025	636 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	RNF181	Q9P0P0	153 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	SDS	P20132	328 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-211	ENST00000582232	PSMD14	O00487	310 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	RAD17	O75943	681 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	MMP14	P50281	582 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	CERS5	Q8N5B7	392 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	GML	Q99445	158 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	MRI	Q9BWK5	157 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	PRDX5	P30044	214 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	MAP3K12	Q12852	859 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	RILPL2	Q969X0	211 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	13.94	□□□□□ -0.18	1e-9	■■■■■ 34.8
GGA3-211	ENST00000582232	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	ABCF2	Q9UG63	623 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	JAG2	Q9Y219	1238 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	GPC2	Q8N158	579 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	DPF2	Q92785	391 aa		13.93	□□□□□ -0.18

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