RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575185.1

SPNS3-203, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS3, Length 496 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-203ENST00000575185 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
SPNS3-203ENST00000575185 SLC10A4Q96EP9 437 aa26.54■■□□□ 1.84
SPNS3-203ENST00000575185 WNK4Q96J92 1243 aa26.54■■□□□ 1.84
SPNS3-203ENST00000575185 CLRN2A0PK11 232 aa26.53■■□□□ 1.84
SPNS3-203ENST00000575185 F8W031 263 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SPNS3-203ENST00000575185 TAF5LO75529 589 aa26.53■■□□□ 1.84
SPNS3-203ENST00000575185 ALDH1A1P00352 501 aa26.53■■□□□ 1.84
SPNS3-203ENST00000575185 SLC4A2P04920 1241 aa26.53■■□□□ 1.84
SPNS3-203ENST00000575185 CSF1RP07333 972 aa26.53■■□□□ 1.84
SPNS3-203ENST00000575185 MAP3K11Q16584 847 aa26.53■■□□□ 1.84
SPNS3-203ENST00000575185 OTOP1Q7RTM1 612 aa26.53■■□□□ 1.84
SPNS3-203ENST00000575185 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SPNS3-203ENST00000575185 POTEFA5A3E0 1075 aa26.52■■□□□ 1.84
SPNS3-203ENST00000575185 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
SPNS3-203ENST00000575185 JAG2Q9Y219 1238 aa26.52■■□□□ 1.84
SPNS3-203ENST00000575185 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SPNS3-203ENST00000575185 GJA5P36382 358 aa26.5■■□□□ 1.83
SPNS3-203ENST00000575185 FLIIQ13045 1269 aa26.5■■□□□ 1.83
SPNS3-203ENST00000575185 CFAP100Q494V2 611 aa26.5■■□□□ 1.83
SPNS3-203ENST00000575185 MTMR14Q8NCE2 650 aa26.5■■□□□ 1.83
SPNS3-203ENST00000575185 CACNA1FO60840 1977 aa26.49■■□□□ 1.83
SPNS3-203ENST00000575185 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
SPNS3-203ENST00000575185 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
SPNS3-203ENST00000575185 VEZTQ9HBM0 779 aa26.49■■□□□ 1.83
SPNS3-203ENST00000575185 SPDYE2BA6NHP3 402 aa26.48■■□□□ 1.83
SPNS3-203ENST00000575185 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
SPNS3-203ENST00000575185 SPDYE6P0CI01 402 aa26.48■■□□□ 1.83
SPNS3-203ENST00000575185 INHBEP58166 350 aa26.48■■□□□ 1.83
SPNS3-203ENST00000575185 CD99L2Q8TCZ2 262 aa26.48■■□□□ 1.83
SPNS3-203ENST00000575185 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.48■■□□□ 1.83
SPNS3-203ENST00000575185 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa26.48■■□□□ 1.83
SPNS3-203ENST00000575185 ARAP2Q8WZ64 1704 aa26.48■■□□□ 1.83
SPNS3-203ENST00000575185 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa26.47■■□□□ 1.83
SPNS3-203ENST00000575185 CAP1Q01518 475 aa26.47■■□□□ 1.83
SPNS3-203ENST00000575185 CRHR2Q13324 411 aa26.47■■□□□ 1.83
SPNS3-203ENST00000575185 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
SPNS3-203ENST00000575185 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.47■■□□□ 1.83
SPNS3-203ENST00000575185 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
SPNS3-203ENST00000575185 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
SPNS3-203ENST00000575185 IL1R1P14778 569 aa26.45■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 FOXO4P98177 505 aa26.45■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 LINS1Q8NG48 757 aa26.45■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 MYO1BO43795 1136 aa26.44■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 USP2O75604 605 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa26.44■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 ZNF804AQ7Z570 1209 aa26.44■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 WWC1Q8IX03 1113 aa26.44■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 PTPN18Q99952 460 aa26.44■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 PTPN22Q9Y2R2 807 aa26.44■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 CHMP3Q9Y3E7 222 aa26.44■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 RASA3Q14644 834 aa26.43■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 GCC1Q96CN9 775 aa26.43■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 ERO1AQ96HE7 468 aa26.43■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 IREB2P48200 963 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP26.42■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 CCDC184Q52MB2 194 aa26.42■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 CDAN1Q8IWY9 1227 aa26.42■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa26.42■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 ELP3Q9H9T3 547 aa26.41■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 PLIN1O60240 522 aa26.4■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 CCDC27Q2M243 656 aa26.4■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa26.4■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 UNCXA6NJT0 531 aa26.39■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 F6X3S4 739 aa26.39■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 EN2P19622 333 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 EPHA10Q5JZY3 1008 aa26.39■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa26.39■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 OPTNQ96CV9 577 aa26.39■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 EFCC1Q9HA90 598 aa26.39■■□□□ 1.82
SPNS3-203ENST00000575185 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.39■■□□□ 1.81
SPNS3-203ENST00000575185 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
SPNS3-203ENST00000575185 SP3Q02447 781 aa26.38■■□□□ 1.81
SPNS3-203ENST00000575185 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa26.38■■□□□ 1.81
SPNS3-203ENST00000575185 LMBR1LQ6UX01 489 aa26.38■■□□□ 1.81
SPNS3-203ENST00000575185 ARMC5Q96C12 935 aa26.38■■□□□ 1.81
SPNS3-203ENST00000575185 ANP32CO43423 234 aa26.37■■□□□ 1.81
SPNS3-203ENST00000575185 SPDYE2Q495Y8 402 aa26.36■■□□□ 1.81
SPNS3-203ENST00000575185 MS4A4AQ96JQ5 239 aa26.36■■□□□ 1.81
SPNS3-203ENST00000575185 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
SPNS3-203ENST00000575185 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
SPNS3-203ENST00000575185 IL16Q14005 1332 aa26.36■■□□□ 1.81
SPNS3-203ENST00000575185 BEND3Q5T5X7 828 aa26.35■■□□□ 1.81
SPNS3-203ENST00000575185 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa26.35■■□□□ 1.81
SPNS3-203ENST00000575185 TEPSINQ96N21 525 aa26.35■■□□□ 1.81
SPNS3-203ENST00000575185 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
SPNS3-203ENST00000575185 FAM205AQ6ZU69 1335 aa26.35■■□□□ 1.81
SPNS3-203ENST00000575185 MFSD14BQ5SR56 506 aa26.34■■□□□ 1.81
SPNS3-203ENST00000575185 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
SPNS3-203ENST00000575185 BRI3BPQ8WY22 251 aa26.34■■□□□ 1.81
SPNS3-203ENST00000575185 CNNM1Q9NRU3 951 aa26.34■■□□□ 1.81
SPNS3-203ENST00000575185 VAMP4O75379 141 aa26.33■■□□□ 1.81
SPNS3-203ENST00000575185 GYG1P46976 350 aa26.33■■□□□ 1.81
SPNS3-203ENST00000575185 CCDC57Q2TAC2 916 aa26.33■■□□□ 1.81
SPNS3-203ENST00000575185 TAF7LQ5H9L4 462 aa26.33■■□□□ 1.81
SPNS3-203ENST00000575185 TCP10L2B9ZVM9 353 aa26.32■■□□□ 1.8
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