RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572083.5

CCDC40-206, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC40, Length 816 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-206ENST00000572083 CLRN2A0PK11 232 aa25.42■■□□□ 1.66
CCDC40-206ENST00000572083 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
CCDC40-206ENST00000572083 INHBEP58166 350 aa25.42■■□□□ 1.66
CCDC40-206ENST00000572083 GCKRQ14397 625 aa25.42■■□□□ 1.66
CCDC40-206ENST00000572083 CASP7P55210 303 aa25.41■■□□□ 1.66
CCDC40-206ENST00000572083 IRS2Q9Y4H2 1338 aa25.4■■□□□ 1.66
CCDC40-206ENST00000572083 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CCDC40-206ENST00000572083 TAF5LO75529 589 aa25.4■■□□□ 1.66
CCDC40-206ENST00000572083 MTMR14Q8NCE2 650 aa25.4■■□□□ 1.66
CCDC40-206ENST00000572083 GCC1Q96CN9 775 aa25.4■■□□□ 1.66
CCDC40-206ENST00000572083 VEZTQ9HBM0 779 aa25.4■■□□□ 1.66
CCDC40-206ENST00000572083 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa25.4■■□□□ 1.66
CCDC40-206ENST00000572083 SLC4A2P04920 1241 aa25.39■■□□□ 1.66
CCDC40-206ENST00000572083 CSF1RP07333 972 aa25.39■■□□□ 1.66
CCDC40-206ENST00000572083 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CCDC40-206ENST00000572083 CFAP100Q494V2 611 aa25.39■■□□□ 1.66
CCDC40-206ENST00000572083 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CCDC40-206ENST00000572083 CD99L2Q8TCZ2 262 aa25.39■■□□□ 1.66
CCDC40-206ENST00000572083 JAG2Q9Y219 1238 aa25.39■■□□□ 1.66
CCDC40-206ENST00000572083 AOX1Q06278 1338 aa25.38■■□□□ 1.65
CCDC40-206ENST00000572083 SPDYE2BA6NHP3 402 aa25.38■■□□□ 1.65
CCDC40-206ENST00000572083 SPDYE6P0CI01 402 aa25.38■■□□□ 1.65
CCDC40-206ENST00000572083 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
CCDC40-206ENST00000572083 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.38■■□□□ 1.65
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CCDC40-206ENST00000572083 MYO1BO43795 1136 aa25.37■■□□□ 1.65
CCDC40-206ENST00000572083 GJA5P36382 358 aa25.37■■□□□ 1.65
CCDC40-206ENST00000572083 FLIIQ13045 1269 aa25.37■■□□□ 1.65
CCDC40-206ENST00000572083 CRHR2Q13324 411 aa25.37■■□□□ 1.65
CCDC40-206ENST00000572083 OTOFQ9HC10 1997 aa25.36■■□□□ 1.65
CCDC40-206ENST00000572083 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa25.36■■□□□ 1.65
CCDC40-206ENST00000572083 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.36■■□□□ 1.65
CCDC40-206ENST00000572083 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CCDC40-206ENST00000572083 ERO1AQ96HE7 468 aa25.36■■□□□ 1.65
CCDC40-206ENST00000572083 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
CCDC40-206ENST00000572083 PTPN22Q9Y2R2 807 aa25.36■■□□□ 1.65
CCDC40-206ENST00000572083 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
CCDC40-206ENST00000572083 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
CCDC40-206ENST00000572083 ZNF804AQ7Z570 1209 aa25.35■■□□□ 1.65
CCDC40-206ENST00000572083 DNAAF4Q8WXU2 420 aa25.35■■□□□ 1.65
CCDC40-206ENST00000572083 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP25.34■■□□□ 1.65
CCDC40-206ENST00000572083 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CCDC40-206ENST00000572083 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CCDC40-206ENST00000572083 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.34■■□□□ 1.65
CCDC40-206ENST00000572083 USP2O75604 605 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CCDC40-206ENST00000572083 IL1R1P14778 569 aa25.33■■□□□ 1.65
CCDC40-206ENST00000572083 RASA3Q14644 834 aa25.33■■□□□ 1.65
CCDC40-206ENST00000572083 LINS1Q8NG48 757 aa25.33■■□□□ 1.65
CCDC40-206ENST00000572083 UNCXA6NJT0 531 aa25.32■■□□□ 1.64
CCDC40-206ENST00000572083 CAP1Q01518 475 aa25.32■■□□□ 1.64
CCDC40-206ENST00000572083 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CCDC40-206ENST00000572083 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.32■■□□□ 1.64
CCDC40-206ENST00000572083 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa25.32■■□□□ 1.64
CCDC40-206ENST00000572083 PTPN18Q99952 460 aa25.32■■□□□ 1.64
CCDC40-206ENST00000572083 EFCC1Q9HA90 598 aa25.32■■□□□ 1.64
CCDC40-206ENST00000572083 ELP3Q9H9T3 547 aa25.31■■□□□ 1.64
CCDC40-206ENST00000572083 EN2P19622 333 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
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CCDC40-206ENST00000572083 ARMC5Q96C12 935 aa25.3■■□□□ 1.64
CCDC40-206ENST00000572083 OPTNQ96CV9 577 aa25.3■■□□□ 1.64
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CCDC40-206ENST00000572083 PLIN1O60240 522 aa25.28■■□□□ 1.64
CCDC40-206ENST00000572083 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CCDC40-206ENST00000572083 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CCDC40-206ENST00000572083 CDAN1Q8IWY9 1227 aa25.27■■□□□ 1.64
CCDC40-206ENST00000572083 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.26■■□□□ 1.63
CCDC40-206ENST00000572083 CCDC27Q2M243 656 aa25.26■■□□□ 1.63
CCDC40-206ENST00000572083 SPDYE2Q495Y8 402 aa25.26■■□□□ 1.63
CCDC40-206ENST00000572083 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa25.26■■□□□ 1.63
CCDC40-206ENST00000572083 F6X3S4 739 aa25.25■■□□□ 1.63
CCDC40-206ENST00000572083 TNFAIP1Q13829 316 aa25.25■■□□□ 1.63
CCDC40-206ENST00000572083 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.25■■□□□ 1.63
CCDC40-206ENST00000572083 MFSD14BQ5SR56 506 aa25.25■■□□□ 1.63
CCDC40-206ENST00000572083 LMBR1LQ6UX01 489 aa25.25■■□□□ 1.63
CCDC40-206ENST00000572083 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.25■■□□□ 1.63
CCDC40-206ENST00000572083 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
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CCDC40-206ENST00000572083 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.24■■□□□ 1.63
CCDC40-206ENST00000572083 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa25.24■■□□□ 1.63
CCDC40-206ENST00000572083 ZNF333Q96JL9 665 aa25.24■■□□□ 1.63
CCDC40-206ENST00000572083 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.24■■□□□ 1.63
CCDC40-206ENST00000572083 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CCDC40-206ENST00000572083 IL16Q14005 1332 aa25.23■■□□□ 1.63
CCDC40-206ENST00000572083 FAM205AQ6ZU69 1335 aa25.23■■□□□ 1.63
CCDC40-206ENST00000572083 CCDC57Q2TAC2 916 aa25.23■■□□□ 1.63
CCDC40-206ENST00000572083 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CCDC40-206ENST00000572083 BRI3BPQ8WY22 251 aa25.23■■□□□ 1.63
CCDC40-206ENST00000572083 CACNA1FO60840 1977 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC40-206ENST00000572083 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC40-206ENST00000572083 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC40-206ENST00000572083 VGLL4Q14135 290 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC40-206ENST00000572083 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CCDC40-206ENST00000572083 CCL15Q16663 113 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC40-206ENST00000572083 CCDC184Q52MB2 194 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC40-206ENST00000572083 BEND3Q5T5X7 828 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC40-206ENST00000572083 TEPSINQ96N21 525 aa25.22■■□□□ 1.63
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