RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568468.5

GINS3-210, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene GINS3, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-210ENST00000568468 CNNM1Q9NRU3 951 aa7.49□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
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GINS3-210ENST00000568468 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 RAB11FIP3O75154 756 aa7.48□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 TAF5LO75529 589 aa7.48□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 TGFB2P61812 414 aa7.48□□□□□ -1.21
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GINS3-210ENST00000568468 CRY2Q49AN0 593 aa7.48□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 RIC1Q4ADV7 1423 aa7.48□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 METTL24Q5JXM2 366 aa7.48□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 OLFM4Q6UX06 510 aa7.48□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 KIF1BPQ96EK5 621 aa7.48□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 KCNK17Q96T54 332 aa7.48□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 MPHOSPH8Q99549 860 aa7.48□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 BRIP1Q9BX63 1249 aa7.48□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa7.48□□□□□ -1.21
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GINS3-210ENST00000568468 ADORA1P30542 326 aa7.47□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 PDE6BP35913 854 aa7.47□□□□□ -1.21
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GINS3-210ENST00000568468 CHRNDQ07001 517 aa7.47□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa7.47□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 AACSQ86V21 672 aa7.47□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 CEP126Q9P2H0 1117 aa7.47□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 RTL9Q8NET4 1388 aa7.46□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 LAMB2P55268 1798 aa7.46□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 GRXCR2A6NFK2 248 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 H0YIN7 160 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 CIAO1O76071 339 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 NPR1P16066 1061 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 PTPREP23469 700 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 IL15P40933 162 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 PSEN2P49810 448 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 TIMM10P62072 90 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 TNNI3KQ59H18 835 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 ADGRD1Q6QNK2 874 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 ERC1Q8IUD2 1116 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 NEUROD6Q96NK8 337 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 DBNDD2Q9BQY9 259 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
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GINS3-210ENST00000568468 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 ZNF609O15014 1411 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 A0A1B0GUL7 405 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 KLRK1P26718 216 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 GPSM2P81274 684 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 ATP2B3Q16720 1220 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 VGLL2Q8N8G2 317 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 MASTLQ96GX5 879 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 CRAMP1Q96RY5 1269 aa7.45□□□□□ -1.22
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GINS3-210ENST00000568468 TAF1P21675 1872 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
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GINS3-210ENST00000568468 GPR162Q16538 588 aa7.44□□□□□ -1.22
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GINS3-210ENST00000568468 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa7.44□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 SALL3Q9BXA9 1300 aa7.44□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 SPEF2Q9C093 1822 aa7.43□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 MYH3P11055 1940 aa7.43□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 C21orf2O43822 256 aa7.43□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 PDE8BO95263 885 aa7.43□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 MX1P20591 662 aa7.43□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 COL9A1P20849 921 aa7.43□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 FGFR2P21802 821 aa7.43□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 PHKA1P46020 1223 aa7.43□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 GYG1P46976 350 aa7.43□□□□□ -1.22
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