RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 JAG2Q9Y219 1238 aa22.82■■□□□ 1.24
USP3-AS1-203ENST00000559737 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.81■■□□□ 1.24
USP3-AS1-203ENST00000559737 ATP5JP18859 108 aa22.81■■□□□ 1.24
USP3-AS1-203ENST00000559737 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.81■■□□□ 1.24
USP3-AS1-203ENST00000559737 SNRKQ9NRH2 765 aa22.81■■□□□ 1.24
USP3-AS1-203ENST00000559737 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.81■■□□□ 1.24
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.81■■□□□ 1.24
USP3-AS1-203ENST00000559737 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.81■■□□□ 1.24
USP3-AS1-203ENST00000559737 RGS3P49796 1198 aa22.8■■□□□ 1.24
USP3-AS1-203ENST00000559737 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.8■■□□□ 1.24
USP3-AS1-203ENST00000559737 GTF2IP78347 998 aa22.79■■□□□ 1.24
USP3-AS1-203ENST00000559737 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
USP3-AS1-203ENST00000559737 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.79■■□□□ 1.24
USP3-AS1-203ENST00000559737 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.78■■□□□ 1.24
USP3-AS1-203ENST00000559737 SEMA3EO15041 775 aa22.78■■□□□ 1.24
USP3-AS1-203ENST00000559737 SPATA5Q8NB90 893 aa22.78■■□□□ 1.24
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.24
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
USP3-AS1-203ENST00000559737 PSME4Q14997 1843 aa22.78■■□□□ 1.24
USP3-AS1-203ENST00000559737 FZD9O00144 591 aa22.77■■□□□ 1.24
USP3-AS1-203ENST00000559737 ERC2O15083 957 aa22.77■■□□□ 1.24
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZBTB22O15209 634 aa22.77■■□□□ 1.24
USP3-AS1-203ENST00000559737 RAD17O75943 681 aa22.77■■□□□ 1.24
USP3-AS1-203ENST00000559737 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZAP70P43403 619 aa22.77■■□□□ 1.24
USP3-AS1-203ENST00000559737 FBXW7Q969H0 707 aa22.77■■□□□ 1.24
USP3-AS1-203ENST00000559737 AOX1Q06278 1338 aa22.76■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.76■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 CXCL9Q07325 125 aa22.76■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.76■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 HAUS7Q99871 368 aa22.76■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 USP17L3A6NCW0 530 aa22.75■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 USP17L4A6NCW7 530 aa22.75■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.75■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 MXD3Q9BW11 206 aa22.75■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.74■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.74■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.74■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 PSMD14O00487 310 aa22.74■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 DACT2Q5SW24 774 aa22.74■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.74■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 GOLIM4O00461 696 aa22.73■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.73■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 CERS5Q8N5B7 392 aa22.73■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.73■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 GRIK5Q16478 980 aa22.72■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.72■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 TTC22Q5TAA0 569 aa22.72■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.72■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 ABCF2Q9UG63 623 aa22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-203ENST00000559737 TNIP1Q15025 636 aa22.7■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.7■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.7■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.7■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 PRDX5P30044 214 aa22.69■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 DOCK2Q92608 1830 aa22.68■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.68■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 AK9Q5TCS8 1911 aa22.67■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 RILPL2Q969X0 211 aa22.67■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 GMLQ99445 158 aa22.66■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.66■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 F8W031 263 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 LDHBP07195 334 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 SDSP20132 328 aa22.65■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.65■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.65■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 GPC2Q8N158 579 aa22.65■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.65■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 EVI5LQ96CN4 794 aa22.65■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 CNTROBQ8N137 903 aa22.65■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 RAI14Q9P0K7 980 aa22.65■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 MYH7P12883 1935 aa22.64■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.64■■□□□ 1.22
USP3-AS1-203ENST00000559737 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.64■■□□□ 1.21
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF384Q8TF68 577 aa22.64■■□□□ 1.21
USP3-AS1-203ENST00000559737 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.64■■□□□ 1.21
USP3-AS1-203ENST00000559737 CHGBP05060 677 aa22.63■■□□□ 1.21
USP3-AS1-203ENST00000559737 MECOMQ03112 1051 aa22.63■■□□□ 1.21
USP3-AS1-203ENST00000559737 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.63■■□□□ 1.21
USP3-AS1-203ENST00000559737 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms