RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-233ENST00000552688 GCKRQ14397 625 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-233ENST00000552688 ARHGEF6Q15052 776 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-233ENST00000552688 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CS-233ENST00000552688 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-233ENST00000552688 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-233ENST00000552688 CHRNDQ07001 517 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-233ENST00000552688 OTOP1Q7RTM1 612 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-233ENST00000552688 ZNF804AQ7Z570 1209 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-233ENST00000552688 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-233ENST00000552688 TSPYL6Q8N831 410 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-233ENST00000552688 LINS1Q8NG48 757 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-233ENST00000552688 WNK4Q96J92 1243 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-233ENST00000552688 PTPN22Q9Y2R2 807 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-233ENST00000552688 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-233ENST00000552688 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-233ENST00000552688 SPDYE2BA6NHP3 402 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-233ENST00000552688 SLC4A2P04920 1241 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-233ENST00000552688 SPDYE6P0CI01 402 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-233ENST00000552688 IL1R1P14778 569 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-233ENST00000552688 KLRK1P26718 216 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-233ENST00000552688 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-233ENST00000552688 TNFAIP1Q13829 316 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-233ENST00000552688 CCDC27Q2M243 656 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-233ENST00000552688 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-233ENST00000552688 ARMC5Q96C12 935 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-233ENST00000552688 PSME4Q14997 1843 aa8.71□□□□□ -1.01
CS-233ENST00000552688 CCER2I3L3R5 266 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 USP2O75604 605 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 CASP7P55210 303 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 SP3Q02447 781 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 CFAP100Q494V2 611 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 NBPF11Q86T75 865 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 CERS5Q8N5B7 392 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 DNAAF4Q8WXU2 420 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 TMEM106CQ9BVX2 250 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 EFCC1Q9HA90 598 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 POTEFA5A3E0 1075 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 TAF5LO75529 589 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 FLIIQ13045 1269 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 CRHR2Q13324 411 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 RASA3Q14644 834 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 CLMNQ96JQ2 1002 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 VEZTQ9HBM0 779 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 IL16Q14005 1332 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 IRS2Q9Y4H2 1338 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 CLRN2A0PK11 232 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 F8W031 263 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 GTF2A2P52657 109 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 G2E3Q7L622 706 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 WWC1Q8IX03 1113 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 CD99L2Q8TCZ2 262 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 SERPINA10Q9UK55 444 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 FZD1Q9UP38 647 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 GNRH1P01148 92 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 TNNI2P48788 182 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 MAP3K9P80192 1104 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 FOXO4P98177 505 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 UBE4AQ14139 1066 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 CCDC57Q2TAC2 916 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 SPDYE2Q495Y8 402 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 MFSD14BQ5SR56 506 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 OPTNQ96CV9 577 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 MS4A4AQ96JQ5 239 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 PTPN18Q99952 460 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 FAM205AQ6ZU69 1335 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 SSC5DA1L4H1 1573 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 SNAP23O00161 211 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 EN2P19622 333 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 GJA5P36382 358 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 KIF22Q14807 665 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 TAF7LQ5H9L4 462 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 HOOK2Q96ED9 719 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 ZNF333Q96JL9 665 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 ELP3Q9H9T3 547 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 CNNM1Q9NRU3 951 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 CSADQ9Y600 493 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 GRM8O00222 908 aa8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms