RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545436.5

LMO3-232, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 530 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-232ENST00000545436 PSME4Q14997 1843 aa15.06■□□□□ 0
LMO3-232ENST00000545436 MCAMP43121 646 aa15.05■□□□□ -0
LMO3-232ENST00000545436 GYG1P46976 350 aa15.05■□□□□ -0
LMO3-232ENST00000545436 MMP14P50281 582 aa15.05■□□□□ -0
LMO3-232ENST00000545436 BCAMP50895 628 aa15.05■□□□□ -0
LMO3-232ENST00000545436 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
LMO3-232ENST00000545436 RASGRF1Q13972 1273 aa15.05■□□□□ -0
LMO3-232ENST00000545436 RUFY2Q8WXA3 655 aa15.05■□□□□ -0
LMO3-232ENST00000545436 CD209Q9NNX6 404 aa15.05■□□□□ -0
LMO3-232ENST00000545436 FAM205AQ6ZU69 1335 aa15.05■□□□□ -0
LMO3-232ENST00000545436 MAST2Q6P0Q8 1798 aa15.04■□□□□ -0
LMO3-232ENST00000545436 RAD50Q92878 1312 aa15.04■□□□□ -0
LMO3-232ENST00000545436 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
LMO3-232ENST00000545436 CERS3Q8IU89 383 aa15.04■□□□□ -0
LMO3-232ENST00000545436 HMG20BQ9P0W2 317 aa15.04■□□□□ -0
LMO3-232ENST00000545436 BCS1LQ9Y276 419 aa15.04■□□□□ -0
LMO3-232ENST00000545436 CHD4Q14839 1912 aa15.04■□□□□ -0
LMO3-232ENST00000545436 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa15.03■□□□□ -0
LMO3-232ENST00000545436 G3V3G9 751 aa15.03■□□□□ -0
LMO3-232ENST00000545436 SNAP23O00161 211 aa15.03■□□□□ -0
LMO3-232ENST00000545436 MAP3K12Q12852 859 aa15.03■□□□□ -0
LMO3-232ENST00000545436 DCAF8Q5TAQ9 597 aa15.03■□□□□ -0
LMO3-232ENST00000545436 TSHZ3Q63HK5 1081 aa15.03■□□□□ -0
LMO3-232ENST00000545436 NLGN2Q8NFZ4 835 aa15.03■□□□□ -0
LMO3-232ENST00000545436 BCL11AQ9H165 835 aa15.03■□□□□ -0
LMO3-232ENST00000545436 MYO3BQ8WXR4 1341 aa15.02■□□□□ -0
LMO3-232ENST00000545436 GOLIM4O00461 696 aa15.02■□□□□ -0
LMO3-232ENST00000545436 RILPL2Q969X0 211 aa15.02■□□□□ -0
LMO3-232ENST00000545436 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
LMO3-232ENST00000545436 FSD1Q9BTV5 496 aa15.02■□□□□ -0
LMO3-232ENST00000545436 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 PPIP5K2O43314 1243 aa15.01□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 IARSP41252 1262 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 ZAP70P43403 619 aa15.01□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 UBE3CQ15386 1083 aa15.01□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 STRIP1Q5VSL9 837 aa15.01□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 TXNRD3Q86VQ6 643 aa15.01□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 SKAP1Q86WV1 359 aa15.01□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 SLF2Q8IX21 1173 aa15.01□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa15.01□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 MAST3O60307 1309 aa15□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 KLRK1P26718 216 aa15□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 SCARF1Q14162 830 aa15□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 JDP2Q8WYK2 163 aa15□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 SNRKQ9NRH2 765 aa15□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 HELLSQ9NRZ9 838 aa15□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 GRIN3BO60391 1043 aa14.99□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 REC8O95072 547 aa14.99□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 CHMLP26374 656 aa14.99□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 GSTO1P78417 241 aa14.99□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 C8orf34Q49A92 452 aa14.99□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 OLFM4Q6UX06 510 aa14.99□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa14.99□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 NIM1KQ8IY84 436 aa14.99□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 LARGE2Q8N3Y3 721 aa14.99□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 MRIQ9BWK5 157 aa14.99□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 NFKBIEO00221 500 aa14.98□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 ECE2O60344 883 aa14.98□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 ERICH6Q7L0X2 663 aa14.98□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 APPBP2Q92624 585 aa14.98□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 BACH2Q9BYV9 841 aa14.98□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 LRP2BPQ9P2M1 347 aa14.98□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 ZNRF3Q9ULT6 936 aa14.98□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa14.98□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 USP17L3A6NCW0 530 aa14.97□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 USP17L4A6NCW7 530 aa14.97□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 RIMBP2O15034 1052 aa14.97□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 LDHCP07864 332 aa14.97□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 LMNB1P20700 586 aa14.97□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 ADD2P35612 726 aa14.97□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 AOC3Q16853 763 aa14.97□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 TTLL5Q6EMB2 1281 aa14.97□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 USP17L1Q7RTZ2 530 aa14.97□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 IDH1O75874 414 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 LDHBP07195 334 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 MFSD14BQ5SR56 506 aa14.96□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa14.96□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 IL27Q8NEV9 243 aa14.96□□□□□ -0.01
LMO3-232ENST00000545436 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
LMO3-232ENST00000545436 SBF1O95248 1867 aa14.95□□□□□ -0.02
LMO3-232ENST00000545436 SGSM2O43147 1006 aa14.95□□□□□ -0.02
LMO3-232ENST00000545436 PDE6AP16499 860 aa14.95□□□□□ -0.02
LMO3-232ENST00000545436 TNIP1Q15025 636 aa14.95□□□□□ -0.02
LMO3-232ENST00000545436 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa14.95□□□□□ -0.02
LMO3-232ENST00000545436 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa14.95□□□□□ -0.02
LMO3-232ENST00000545436 PI16Q6UXB8 463 aa14.95□□□□□ -0.02
LMO3-232ENST00000545436 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
LMO3-232ENST00000545436 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa14.95□□□□□ -0.02
LMO3-232ENST00000545436 ANTXR1Q9H6X2 564 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms