RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543473.1

SUDS3-204, Transcript of SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUDS3, Length 4,897 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3-204ENST00000543473 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.05■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.05■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 LRMPQ12912 555 aa22.05■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 IMPACTQ9P2X3 320 aa22.05■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 MYO1BO43795 1136 aa22.05■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 STX17P56962 302 aa22.05■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.05■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.05■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 KRT86O43790 486 aa22.05■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 BMP15O95972 392 aa22.05■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 RAB34Q9BZG1 259 aa22.05■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 SLC27A2O14975 620 aa22.04■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 ATP2C2O75185 946 aa22.04■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 SBNO1A3KN83 1393 aa22.04■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 NOP2P46087 812 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 MYZAPP0CAP1 466 aa22.04■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 AMPD3Q01432 767 aa22.04■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.04■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 DHX58Q96C10 678 aa22.04■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa22.03■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 OTUD6BQ8N6M0 293 aa22.03■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.03■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 NF2P35240 595 aa22.03■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 FANCCQ00597 558 aa22.03■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 DDB1Q16531 1140 aa22.03■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 C8orf37Q96NL8 207 aa22.03■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 KRT83P78385 493 aa22.03■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 DMTNQ08495 405 aa22.03■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.03■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.03■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 TACC1O75410 805 aa22.03■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 WTAPQ15007 396 aa22.03■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 CAPZA3Q96KX2 299 aa22.03■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.03■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 A0A1B0GUL7 405 aa22.02■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 CCDC40Q4G0X9 1142 aa22.02■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 SLC5A1P13866 664 aa22.02■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.02■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 PALD1Q9ULE6 856 aa22.02■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 KIF5AQ12840 1032 aa22.02■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa22.02■■□□□ 1.12
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SUDS3-204ENST00000543473 DCAF5Q96JK2 942 aa22.02■■□□□ 1.11
SUDS3-204ENST00000543473 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
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SUDS3-204ENST00000543473 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.01■■□□□ 1.11
SUDS3-204ENST00000543473 ABCC4O15439 1325 aa22.01■■□□□ 1.11
SUDS3-204ENST00000543473 ELP1O95163 1332 aa22.01■■□□□ 1.11
SUDS3-204ENST00000543473 RTN1Q16799 776 aa22.01■■□□□ 1.11
SUDS3-204ENST00000543473 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SUDS3-204ENST00000543473 CHMP4BP1P59074 171 aa22.01■■□□□ 1.11
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SUDS3-204ENST00000543473 PYCARDQ9ULZ3 195 aa22■■□□□ 1.11
SUDS3-204ENST00000543473 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22■■□□□ 1.11
SUDS3-204ENST00000543473 VGLL3A8MV65 326 aa22■■□□□ 1.11
SUDS3-204ENST00000543473 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
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SUDS3-204ENST00000543473 KDM5DQ9BY66 1539 aa22■■□□□ 1.11
SUDS3-204ENST00000543473 TRIM75PA6NK02 468 aa22■■□□□ 1.11
SUDS3-204ENST00000543473 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
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SUDS3-204ENST00000543473 CALML4Q96GE6 196 aa22■■□□□ 1.11
SUDS3-204ENST00000543473 ERBB4Q15303 1308 aa22■■□□□ 1.11
SUDS3-204ENST00000543473 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22■■□□□ 1.11
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SUDS3-204ENST00000543473 PSMA7O14818 248 aa21.99■■□□□ 1.11
SUDS3-204ENST00000543473 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa21.99■■□□□ 1.11
SUDS3-204ENST00000543473 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
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SUDS3-204ENST00000543473 UBA5Q9GZZ9 404 aa21.98■■□□□ 1.11
SUDS3-204ENST00000543473 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.117e-7■■■■■ 48.1
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SUDS3-204ENST00000543473 ZNF287Q9HBT7 754 aa21.98■■□□□ 1.11
SUDS3-204ENST00000543473 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.98■■□□□ 1.11
SUDS3-204ENST00000543473 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SUDS3-204ENST00000543473 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.98■■□□□ 1.11
SUDS3-204ENST00000543473 BTG4Q9NY30 223 aa21.98■■□□□ 1.11
SUDS3-204ENST00000543473 ATP6V1AP38606 617 aa21.97■■□□□ 1.11
SUDS3-204ENST00000543473 STAT6P42226 847 aa21.97■■□□□ 1.11
SUDS3-204ENST00000543473 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SUDS3-204ENST00000543473 CCDC42Q96M95 316 aa21.97■■□□□ 1.11
SUDS3-204ENST00000543473 KRT23Q9C075 422 aa21.97■■□□□ 1.11
SUDS3-204ENST00000543473 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SUDS3-204ENST00000543473 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.97■■□□□ 1.11
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