RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538860.1

ADD1-223, Transcript of adducin 1, human

TSL 3

Gene ADD1, Length 507 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ADD1-223	ENST00000538860	OGFOD1	Q8N543	542 aa		18.31	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		18.31	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		18.31	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	SCN9A	Q15858	1988 aa		18.3	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	TNNI3K	Q59H18	835 aa		18.3	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	CHADL	Q6NUI6	762 aa		18.3	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	XAGE2	Q96GT9	111 aa		18.3	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	CRBN	Q96SW2	442 aa		18.3	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	MRI	Q9BWK5	157 aa		18.3	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		18.3	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	PSME4	Q14997	1843 aa		18.3	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	CCDC102B	Q68D86	513 aa		18.29	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		18.29	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		18.29	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	18.29	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		18.29	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	18.29	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	18.28	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		18.28	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		18.28	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	DCTPP1	Q9H773	170 aa		18.28	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		18.28	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		18.27	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		18.27	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	CERS5	Q8N5B7	392 aa		18.27	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		18.27	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		18.27	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		18.27	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	IGSF3	O75054	1194 aa		18.26	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		18.26	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	PHKA1	P46020	1223 aa		18.26	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	FBXW7	Q969H0	707 aa		18.26	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		18.26	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	CAPN15	O75808	1086 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	ADORA1	P30542	326 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	GORAB	Q5T7V8	394 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	MXD3	Q9BW11	206 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	SHTN1	A0MZ66	631 aa		18.24	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	POTEI	P0CG38	1075 aa		18.24	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	POTEJ	P0CG39	1038 aa		18.24	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	APLP1	P51693	650 aa		18.24	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		18.24	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		18.24	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	CNTROB	Q8N137	903 aa		18.24	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		18.24	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		18.24	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	MAST3	O60307	1309 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	EGFR	P00533	1210 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	RASGRF1	Q13972	1273 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	PASK	Q96RG2	1323 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	WNT10B	O00744	389 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	SCARF1	Q14162	830 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
ADD1-223	ENST00000538860	DLGAP5	Q15398	846 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ADD1-223	ENST00000538860	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
ADD1-223	ENST00000538860	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
ADD1-223	ENST00000538860	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ADD1-223	ENST00000538860	AACS	Q86V21	672 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ADD1-223	ENST00000538860	SPATA5	Q8NB90	893 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ADD1-223	ENST00000538860	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ADD1-223	ENST00000538860	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
ADD1-223	ENST00000538860	GCC1	Q96CN9	775 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ADD1-223	ENST00000538860	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ADD1-223	ENST00000538860	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ADD1-223	ENST00000538860	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
ADD1-223	ENST00000538860	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
ADD1-223	ENST00000538860	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
ADD1-223	ENST00000538860	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	18.19	■□□□□ 0.5
ADD1-223	ENST00000538860	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
ADD1-223	ENST00000538860	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ADD1-223	ENST00000538860	JAG2	Q9Y219	1238 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ADD1-223	ENST00000538860	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ADD1-223	ENST00000538860	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
ADD1-223	ENST00000538860	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms