RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAP3K11Q16584 847 aa24.41■■□□□ 1.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 FBXW7Q969H0 707 aa24.41■■□□□ 1.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 EFCC1Q9HA90 598 aa24.41■■□□□ 1.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 SASH1O94885 1247 aa24.4■■□□□ 1.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 CTSWP56202 376 aa24.4■■□□□ 1.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 BEND3Q5T5X7 828 aa24.4■■□□□ 1.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 CENPFP49454 3210 aa24.4■■□□□ 1.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPEF2Q9C093 1822 aa24.4■■□□□ 1.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP24.39■■□□□ 1.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 SSH1Q8WYL5 1049 aa24.39■■□□□ 1.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 MXD3Q9BW11 206 aa24.39■■□□□ 1.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 CASP7P55210 303 aa24.38■■□□□ 1.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 ARHGEF6Q15052 776 aa24.38■■□□□ 1.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 TTLL5Q6EMB2 1281 aa24.38■■□□□ 1.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.38■■□□□ 1.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.38■■□□□ 1.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.38■■□□□ 1.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 WNK4Q96J92 1243 aa24.38■■□□□ 1.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 DEFB129Q9H1M3 183 aa24.38■■□□□ 1.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.38■■□□□ 1.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa24.38■■□□□ 1.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 SP3Q02447 781 aa24.37■■□□□ 1.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 NBPF11Q86T75 865 aa24.37■■□□□ 1.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 GREM2Q9H772 168 aa24.37■■□□□ 1.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 LEMD3Q9Y2U8 911 aa24.36■■□□□ 1.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 CRHR2Q13324 411 aa24.35■■□□□ 1.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa24.35■■□□□ 1.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 KIAA0825Q8IV33 1275 aa24.35■■□□□ 1.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF333Q96JL9 665 aa24.34■■□□□ 1.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 BRCA2P51587 3418 aa24.33■■□□□ 1.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 DLGAP5Q15398 846 aa24.33■■□□□ 1.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 CLMNQ96JQ2 1002 aa24.33■■□□□ 1.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 PLA2G12BQ9BX93 195 aa24.33■■□□□ 1.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CD27-AS1-208ENST00000538616 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 FZD1Q9UP38 647 aa24.32■■□□□ 1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 MYO1BO43795 1136 aa24.31■■□□□ 1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 IREB2P48200 963 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.31■■□□□ 1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 MTMR14Q8NCE2 650 aa24.31■■□□□ 1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.31■■□□□ 1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 SMC4Q9NTJ3 1288 aa24.31■■□□□ 1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 GTF2IP78347 998 aa24.3■■□□□ 1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa24.3■■□□□ 1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.3■■□□□ 1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 CEP290O15078 2479 aa24.29■■□□□ 1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa24.29■■□□□ 1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 GRM8O00222 908 aa24.29■■□□□ 1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 ALDH1L1O75891 902 aa24.29■■□□□ 1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 CSF1RP07333 972 aa24.29■■□□□ 1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 FOXO4P98177 505 aa24.29■■□□□ 1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.29■■□□□ 1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa24.29■■□□□ 1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 ANKRD2Q9GZV1 360 aa24.29■■□□□ 1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 PTPRCP08575 1304 aa24.29■■□□□ 1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 ITGA6P23229 1130 aa24.28■■□□□ 1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 EPHA10Q5JZY3 1008 aa24.28■■□□□ 1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 LAMB1P07942 1786 aa24.28■■□□□ 1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF804BA4D1E1 1349 aa24.28■■□□□ 1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 OTUD5Q96G74 571 aa24.27■■□□□ 1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 PTPN18Q99952 460 aa24.27■■□□□ 1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 H0YGN5 161 aa24.26■■□□□ 1.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 CHMP3Q9Y3E7 222 aa24.26■■□□□ 1.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa24.25■■□□□ 1.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 SSC5DA1L4H1 1573 aa24.25■■□□□ 1.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP2O75604 605 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 GJA5P36382 358 aa24.24■■□□□ 1.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 LMBR1LQ6UX01 489 aa24.24■■□□□ 1.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa24.24■■□□□ 1.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 KCNJ4P48050 445 aa24.23■■□□□ 1.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 SUCLG2Q96I99 432 aa24.23■■□□□ 1.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 CD209Q9NNX6 404 aa24.23■■□□□ 1.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa24.22■■□□□ 1.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPDYE2BA6NHP3 402 aa24.22■■□□□ 1.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPDYE6P0CI01 402 aa24.22■■□□□ 1.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 CAP1Q01518 475 aa24.22■■□□□ 1.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 OPTNQ96CV9 577 aa24.22■■□□□ 1.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.22■■□□□ 1.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 CFAP100Q494V2 611 aa24.21■■□□□ 1.47
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