RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531298.5

PACS1-211, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-211ENST00000531298 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa8.94□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 DUOX1Q9NRD9 1551 aa8.94□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 F13A1P00488 732 aa8.93□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 NCLP19338 710 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 SYT1P21579 422 aa8.93□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 MCAMP43121 646 aa8.93□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 PIP4K2BP78356 416 aa8.93□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 MAP3K12Q12852 859 aa8.93□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 LINC00116Q8NCU8 138 aa8.93□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa8.93□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 C8orf37Q96NL8 207 aa8.93□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 TPCN1Q9ULQ1 816 aa8.93□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa8.93□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 CASZ1Q86V15 1759 aa8.93□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 TCHHQ07283 1943 aa8.93□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 C4BP0C0L5 1744 aa8.92□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 TIAM2Q8IVF5 1701 aa8.92□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 ZAP70P43403 619 aa8.92□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 MCTP1Q6DN14 999 aa8.92□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 GIMAP6Q6P9H5 292 aa8.92□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 TPTE2Q6XPS3 522 aa8.92□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 SPATA5Q8NB90 893 aa8.92□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 OSBP2Q969R2 916 aa8.92□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 ACSBG1Q96GR2 724 aa8.92□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 ANKRD2Q9GZV1 360 aa8.92□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 MTMR6Q9Y217 621 aa8.92□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 C4AP0C0L4 1744 aa8.91□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 NID2Q14112 1375 aa8.91□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa8.91□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 E7EWF7 191 aa8.91□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 GPAA1O43292 621 aa8.91□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 GJB2P29033 226 aa8.91□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 ADORA1P30542 326 aa8.91□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 MCM5P33992 734 aa8.91□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 UBE2HP62256 183 aa8.91□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP8.91□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 PKP1Q13835 747 aa8.91□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa8.91□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 NCOA7Q8NI08 942 aa8.91□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 TMEM87BQ96K49 555 aa8.91□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 NLRP3Q96P20 1036 aa8.91□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 SETDB2Q96T68 719 aa8.91□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 CHD4Q14839 1912 aa8.9□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 UBR3Q6ZT12 1888 aa8.9□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 SALL1Q9NSC2 1324 aa8.9□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 ZNF213O14771 459 aa8.9□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 KCNQ2O43526 872 aa8.9□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 ZPR1O75312 459 aa8.9□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 FGAP02671 866 aa8.9□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 PDE6AP16499 860 aa8.9□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 ST3GAL1Q11201 340 aa8.9□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 PPP2R5BQ15173 497 aa8.9□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 FAM196AQ6ZSG2 479 aa8.9□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 Q6ZUG5 572 aa8.9□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 TMC4Q7Z404 712 aa8.9□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 CERS3Q8IU89 383 aa8.9□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 CCDC83Q8IWF9 413 aa8.9□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 SYNE4Q8N205 404 aa8.9□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 FAM184AQ8NB25 1140 aa8.9□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 ARXQ96QS3 562 aa8.9□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 CNNM2Q9H8M5 875 aa8.9□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 BCL2L12Q9HB09 334 aa8.9□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 DENND2AQ9ULE3 1009 aa8.9□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
PACS1-211ENST00000531298 MAST2Q6P0Q8 1798 aa8.89□□□□□ -0.99
PACS1-211ENST00000531298 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa8.89□□□□□ -0.99
PACS1-211ENST00000531298 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PACS1-211ENST00000531298 M0R2C6 588 aa8.89□□□□□ -0.99
PACS1-211ENST00000531298 FOXP2O15409 715 aa8.89□□□□□ -0.99
PACS1-211ENST00000531298 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PACS1-211ENST00000531298 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
PACS1-211ENST00000531298 LIFRP42702 1097 aa8.89□□□□□ -0.99
PACS1-211ENST00000531298 PHKA1P46020 1223 aa8.89□□□□□ -0.99
PACS1-211ENST00000531298 KRT85P78386 507 aa8.89□□□□□ -0.99
PACS1-211ENST00000531298 CHRNDQ07001 517 aa8.89□□□□□ -0.99
PACS1-211ENST00000531298 TRDNQ13061 729 aa8.89□□□□□ -0.99
PACS1-211ENST00000531298 SCARF1Q14162 830 aa8.89□□□□□ -0.99
PACS1-211ENST00000531298 WASHC4Q2M389 1173 aa8.89□□□□□ -0.99
PACS1-211ENST00000531298 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa8.89□□□□□ -0.99
PACS1-211ENST00000531298 STOX1Q6ZVD7 989 aa8.89□□□□□ -0.99
PACS1-211ENST00000531298 SGMS1Q86VZ5 419 aa8.89□□□□□ -0.99
PACS1-211ENST00000531298 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
PACS1-211ENST00000531298 TMTC2Q8N394 836 aa8.89□□□□□ -0.99
PACS1-211ENST00000531298 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PACS1-211ENST00000531298 NACAP1Q9BZK3 213 aa8.89□□□□□ -0.99
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