RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3-208ENST00000531226 EGFRP00533 1210 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-208ENST00000531226 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-208ENST00000531226 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-208ENST00000531226 CERS5Q8N5B7 392 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-208ENST00000531226 JAG2Q9Y219 1238 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-208ENST00000531226 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A1B0GUL7 405 aa23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 MMP14P50281 582 aa23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 OGFOD1Q8N543 542 aa23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 MYOZ2Q9NPC6 264 aa23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 PGAP2Q9UHJ9 254 aa23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 HMMRO75330 724 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 ADORA1P30542 326 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 TIMM10P62072 90 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 CNTROBQ8N137 903 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 HDAC9Q9UKV0 1011 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 GPR108Q9NPR9 543 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 PASKQ96RG2 1323 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 PHKA1P46020 1223 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 XAGE2Q96GT9 111 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 AKAP11Q9UKA4 1901 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 ZBTB22O15209 634 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC102BQ68D86 513 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-208ENST00000531226 SEMA3EO15041 775 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-208ENST00000531226 APLP1P51693 650 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-208ENST00000531226 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-208ENST00000531226 TNNI3KQ59H18 835 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-208ENST00000531226 ERC1Q8IUD2 1116 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-208ENST00000531226 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-208ENST00000531226 F8W031 263 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-208ENST00000531226 CRBNQ96SW2 442 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-208ENST00000531226 SCARF1Q14162 830 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-208ENST00000531226 GGA3Q9NZ52 723 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-208ENST00000531226 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-208ENST00000531226 MYH2Q9UKX2 1941 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-208ENST00000531226 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-208ENST00000531226 WNT10BO00744 389 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-208ENST00000531226 WDR66Q8TBY9 1149 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-208ENST00000531226 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-208ENST00000531226 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-208ENST00000531226 NBPF9Q3BBW0 867 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-208ENST00000531226 CDC37L1Q7L3B6 337 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-208ENST00000531226 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-208ENST00000531226 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-208ENST00000531226 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-208ENST00000531226 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-208ENST00000531226 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-208ENST00000531226 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-208ENST00000531226 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-208ENST00000531226 RASGRF1Q13972 1273 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-208ENST00000531226 GRIK5Q16478 980 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-208ENST00000531226 GORABQ5T7V8 394 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-208ENST00000531226 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-208ENST00000531226 SALL1Q9NSC2 1324 aa23.39■■□□□ 1.34
PACSIN3-208ENST00000531226 TRAF5O00463 557 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 DLGAP5Q15398 846 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 CFAP100Q494V2 611 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 RHPN1Q8TCX5 695 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 KIF1BPQ96EK5 621 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 RAB11FIP3O75154 756 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 MAST2Q6P0Q8 1798 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 MAST3O60307 1309 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 USP48Q86UV5 1035 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 SULF1Q8IWU6 871 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 CREBZFQ9NS37 354 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 SPDYE2BA6NHP3 402 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM88BA6NKF7 163 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 ADM5C9JUS6 153 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 SPDYE6P0CI01 402 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 HTRA3P83110 453 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
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