RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530500.5

ATG13-216, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 2 BASIC

Gene ATG13, Length 2,030 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-216	ENST00000530500	RREB1	Q92766	1687 aa		18.98	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	18.98	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500	CTDNEP1	O95476	244 aa		18.98	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		18.98	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500	ATL3	Q6DD88	541 aa		18.98	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		18.98	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		18.98	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500	SLC5A1	P13866	664 aa		18.98	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	18.98	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		18.98	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	18.98	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		18.98	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	18.97	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		18.97	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500	CAMTA2	O94983	1202 aa		18.96	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500	CCDC192	P0DO97	292 aa		18.96	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		18.96	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		18.96	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	18.96	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		18.96	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		18.96	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	18.96	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500	RTL9	Q8NET4	1388 aa		18.96	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500		A0A0G2JS52	829 aa		18.96	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500	PRC1	O43663	620 aa		18.96	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500	PHKA1	P46020	1223 aa		18.96	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500	HAND2	P61296	217 aa		18.96	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500	TRDN	Q13061	729 aa		18.96	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	18.96	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	18.96	■□□□□ 0.63
ATG13-216	ENST00000530500	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	18.95	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	MAP3K11	Q16584	847 aa		18.95	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	CHST3	Q7LGC8	479 aa		18.95	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		18.95	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		18.95	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	SLIT2	O94813	1529 aa		18.95	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	PDE6A	P16499	860 aa		18.94	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	18.94	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	ITPK1	Q13572	414 aa		18.94	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	LIG1	P18858	919 aa		18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	SPATA5	Q8NB90	893 aa		18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	RGS22	Q8NE09	1264 aa		18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	MAP3K12	Q12852	859 aa		18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	TNMD	Q9H2S6	317 aa		18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	DACT1	Q9NYF0	836 aa		18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		18.92	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		18.92	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	ZMYM6	O95789	1325 aa		18.92	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		18.92	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	NTSR2	O95665	410 aa		18.92	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	ALX1	Q15699	326 aa		18.92	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		18.92	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	BICD2	Q8TD16	824 aa		18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	AIDA	Q96BJ3	306 aa		18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	LAMB2	P55268	1798 aa		18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	KDM4A	O75164	1064 aa		18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	APP	P05067	770 aa		18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	PGBD1	Q96JS3	809 aa		18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	FAM177B	A6PVY3	158 aa		18.9	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	ANTXR2	P58335	489 aa		18.9	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		18.9	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		18.9	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	RGL2	O15211	777 aa		18.9	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	RASGRF1	Q13972	1273 aa		18.9	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	USP25	Q9UHP3	1055 aa		18.9	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		18.9	■□□□□ 0.62
ATG13-216	ENST00000530500	CPLX1	O14810	134 aa		18.89	■□□□□ 0.61
ATG13-216	ENST00000530500	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
ATG13-216	ENST00000530500	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
ATG13-216	ENST00000530500	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
ATG13-216	ENST00000530500	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		18.89	■□□□□ 0.61
ATG13-216	ENST00000530500	DOCK2	Q92608	1830 aa		18.89	■□□□□ 0.61
ATG13-216	ENST00000530500	TMEM87B	Q96K49	555 aa		18.88	■□□□□ 0.61
ATG13-216	ENST00000530500	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61

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