RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529170.5

MKNK1-222, Transcript of MAP kinase interacting serine/threonine kinase 1, human

TSL 4

Gene MKNK1, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKNK1-222	ENST00000529170	ITGA6	P23229	1130 aa		10.7	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	10.7	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	CASP7	P55210	303 aa		10.7	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	CRHR2	Q13324	411 aa		10.7	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	DLGAP5	Q15398	846 aa		10.7	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	10.7	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	10.7	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		10.7	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		10.7	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	CLRN2	A0PK11	232 aa		10.69	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	10.69	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	CHRND	Q07001	517 aa		10.69	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	CFAP100	Q494V2	611 aa		10.69	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		10.69	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	ERO1A	Q96HE7	468 aa		10.69	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	EFCC1	Q9HA90	598 aa		10.69	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	BRCA2	P51587	3418 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	UNCX	A6NJT0	531 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170		F8W031	263 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	TAF5L	O75529	589 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	SP3	Q02447	781 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	SPEF2	Q9C093	1822 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	SPDYE6	P0CI01	402 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	GCKR	Q14397	625 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	JAG2	Q9Y219	1238 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	IL1R1	P14778	569 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	KCNJ4	P48050	445 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	RASA3	Q14644	834 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	ZNF333	Q96JL9	665 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	ELP3	Q9H9T3	547 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	VEZT	Q9HBM0	779 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	MYH3	P11055	1940 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	SLC4A2	P04920	1241 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	OPTN	Q96CV9	577 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	TEPSIN	Q96N21	525 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MKNK1-222	ENST00000529170	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	MYO1B	O43795	1136 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	FOXO4	P98177	505 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	CEP290	O15078	2479 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	LAMB1	P07942	1786 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	FLII	Q13045	1269 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	OTUD5	Q96G74	571 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	STK31	Q9BXU1	1019 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170		H0YGN5	161 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	10.62	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	MAP3K9	P80192	1104 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	LINS1	Q8NG48	757 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	PLIN1	O60240	522 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	VGLL4	Q14135	290 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	GRIK5	Q16478	980 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	CCL15	Q16663	113 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MKNK1-222	ENST00000529170	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71

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