RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 FZD1Q9UP38 647 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRU-210ENST00000527027 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PTPRU-210ENST00000527027 SPEF2Q9C093 1822 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRU-210ENST00000527027 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 VAMP4O75379 141 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 IL1R1P14778 569 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 MYO1BO43795 1136 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF804AQ7Z570 1209 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 UNCXA6NJT0 531 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 CFAP100Q494V2 611 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 IFNL1Q8IU54 200 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 SPDYE2BA6NHP3 402 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 F8W031 263 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 SPDYE6P0CI01 402 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 BEND3Q5T5X7 828 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 CLRN2A0PK11 232 aa20.47■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 LMBR1LQ6UX01 489 aa20.47■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 WDR63Q8IWG1 891 aa20.47■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 WNK4Q96J92 1243 aa20.47■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 F6X3S4 739 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 CCDC57Q2TAC2 916 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 VEZTQ9HBM0 779 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRU-210ENST00000527027 PLIN1O60240 522 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 EPHA10Q5JZY3 1008 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 JAG2Q9Y219 1238 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 SSC5DA1L4H1 1573 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 USP2O75604 605 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 RASA3Q14644 834 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 TRIM17Q9Y577 477 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 GRM8O00222 908 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 CNNM1Q9NRU3 951 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 AOX1Q06278 1338 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 OTOP1Q7RTM1 612 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 HTTP42858 3142 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 GJA5P36382 358 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 TNFAIP1Q13829 316 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 UBE4AQ14139 1066 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 SERPINA10Q9UK55 444 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 MFSD14BQ5SR56 506 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 ERO1AQ96HE7 468 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 MRS2Q9HD23 443 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
PTPRU-210ENST00000527027 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 ALDH1L1O75891 902 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 CRHR2Q13324 411 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 PTPN18Q99952 460 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 CACNA1FO60840 1977 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 GYG1P46976 350 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 CD99L2Q8TCZ2 262 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 ELP3Q9H9T3 547 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 SP3Q02447 781 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 OPTNQ96CV9 577 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 TEPSINQ96N21 525 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 EFCC1Q9HA90 598 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 POTEFA5A3E0 1075 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 SUCLG2Q96I99 432 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 MS4A4AQ96JQ5 239 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 CENPFP49454 3210 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms