RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519760.1

CDK1-208, Transcript of cyclin dependent kinase 1, human

TSL 3

Gene CDK1, Length 276 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDK1-208	ENST00000519760	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CDK1-208	ENST00000519760	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CDK1-208	ENST00000519760	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CDK1-208	ENST00000519760	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CDK1-208	ENST00000519760	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CDK1-208	ENST00000519760	GPR182	O15218	404 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	FST	P19883	344 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	WNT8B	Q93098	351 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	FAM129B	Q96TA1	746 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	TCF12	Q99081	682 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	NDUFB5	O43674	189 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	RAX	Q9Y2V3	346 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760		A0A096LPE4	126 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760		A0A1W2PPZ6	126 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	PREP	P48147	710 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	ARL4D	P49703	201 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	GSTM4	Q03013	218 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	ARTN	Q5T4W7	220 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	CCNJL	Q8IV13	435 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	TMC1	Q8TDI8	760 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	USP26	Q9BXU7	913 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	NPHS2	Q9NP85	383 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	HMX2	A2RU54	273 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	CTSB	P07858	339 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	CEP41	Q9BYV8	373 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	STOML1	Q9UBI4	398 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	BMP3	P12645	472 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	DRD2	P14416	443 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	PCDH1	Q08174	1060 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	MYRFL	Q96LU7	910 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	RNF208	Q9H0X6	261 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	MEGF11	A6BM72	1044 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	MED26	O95402	600 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	ECEL1	O95672	775 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	IGLV1-40	P01703	118 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	PDE3B	Q13370	1112 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	PI16	Q6UXB8	463 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	TMC7	Q7Z402	723 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	EHD4	Q9H223	541 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	RNF112	Q9ULX5	631 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CDK1-208	ENST00000519760	SSTR4	P31391	388 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	PDE4C	Q08493	712 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	LRP8	Q14114	963 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	SGO2	Q562F6	1265 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	FDX2	Q6P4F2	183 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	CITED4	Q96RK1	184 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	CSRNP1	Q96S65	589 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	BRD1	O95696	1058 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	TGFB1	P01137	390 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	NEFL	P07196	543 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	MAOB	P27338	520 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	UVSSA	Q2YD98	709 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	BEND4	Q6ZU67	534 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	SHISA5	Q8N114	240 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF576	Q9H609	170 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	ABCB6	Q9NP58	842 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	TIAF1	O95411	115 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	NFIA	Q12857	509 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	GRM2	Q14416	872 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CDK1-208	ENST00000519760	RNF43	Q68DV7	783 aa		5.75	□□□□□ -1.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms