RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514625.1

FAAP20-215, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-215ENST00000514625 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.13■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 JAG2Q9Y219 1238 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 MYOZ2Q9NPC6 264 aa22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.1■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 A0A1B0GUL7 405 aa22.1■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 TIMM10P62072 90 aa22.1■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.1■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.1■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 APLP1P51693 650 aa22.09■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.09■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.09■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.09■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 EGFRP00533 1210 aa22.08■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 GORABQ5T7V8 394 aa22.08■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.08■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 CERS5Q8N5B7 392 aa22.08■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 F8W031 263 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 ADORA1P30542 326 aa22.07■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 XAGE2Q96GT9 111 aa22.07■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 GPR108Q9NPR9 543 aa22.07■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 SEMA3EO15041 775 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 SCARF1Q14162 830 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 CCDC102BQ68D86 513 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 PASKQ96RG2 1323 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 PHKA1P46020 1223 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 DLGAP5Q15398 846 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 TNNI3KQ59H18 835 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 GGA3Q9NZ52 723 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 WNT10BO00744 389 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 ZBTB22O15209 634 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 SULF1Q8IWU6 871 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 CRBNQ96SW2 442 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-215ENST00000514625 RAB11FIP3O75154 756 aa22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 CFAP100Q494V2 611 aa22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 USP48Q86UV5 1035 aa22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 TMEM88BA6NKF7 163 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 TRAF5O00463 557 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 MYO1BO43795 1136 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 RHPN1Q8TCX5 695 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 KIF1BPQ96EK5 621 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 CREBZFQ9NS37 354 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 MAST3O60307 1309 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 APBB1O00213 710 aa21.99■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa21.99■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 RASGRF1Q13972 1273 aa21.98■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 TTC39AQ5SRH9 613 aa21.98■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 DBNDD2Q9BQY9 259 aa21.98■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.98■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.97■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 LDHBP07195 334 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 SPDYE6P0CI01 402 aa21.97■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 AAMPQ13685 434 aa21.97■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 GRIK5Q16478 980 aa21.97■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 AACSQ86V21 672 aa21.97■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 TEKT1Q969V4 418 aa21.97■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 ADM5C9JUS6 153 aa21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 CELF2O95319 508 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
FAAP20-215ENST00000514625 CRKP46108 304 aa21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms