RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514231.1

PDE4D-221, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-221ENST00000514231 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 GPR182O15218 404 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 C19orf57Q0VDD7 668 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 ORC1Q13415 861 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 IKBKEQ14164 716 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 DUOXA2Q1HG44 320 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 CCNJLQ8IV13 435 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 ADAM11O75078 769 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 WISP1O95388 367 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 SLC7A3Q8WY07 619 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 DCTN4Q9UJW0 460 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 ACAD11Q709F0 780 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 TCF12Q99081 682 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 LIN7BQ9HAP6 207 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 A0A096LPE4 126 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 A0A1W2PPZ6 126 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 CEP41Q9BYV8 373 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 METTL12A8MUP2 240 aa9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 GLB1P16278 677 aa9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 PRSS36Q5K4E3 855 aa9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 HGSNATQ68CP4 663 aa9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 TMC7Q7Z402 723 aa9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 CCDC74AQ96AQ1 378 aa9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 CSRNP1Q96S65 589 aa9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 GRIA4P48058 902 aa9.85□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 PRR23CQ6ZRP0 262 aa9.85□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 EHD4Q9H223 541 aa9.85□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa9.85□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 MEGF11A6BM72 1044 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 NLRP12P59046 1061 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 UBASH3BQ8TF42 649 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 NPHS2Q9NP85 383 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-221ENST00000514231 MAPK1P28482 360 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-221ENST00000514231 PLCB3Q01970 1234 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-221ENST00000514231 SPRED3Q2MJR0 410 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-221ENST00000514231 SLC51AQ86UW1 340 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-221ENST00000514231 RNF208Q9H0X6 261 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-221ENST00000514231 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-221ENST00000514231 DSC3Q14574 896 aa9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-221ENST00000514231 UVSSAQ2YD98 709 aa9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-221ENST00000514231 ITPKAP23677 461 aa9.81□□□□□ -0.84
PDE4D-221ENST00000514231 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PDE4D-221ENST00000514231 PCDH1Q08174 1060 aa9.81□□□□□ -0.84
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF423Q2M1K9 1284 aa9.81□□□□□ -0.84
PDE4D-221ENST00000514231 ANKRD34AQ69YU3 496 aa9.81□□□□□ -0.84
PDE4D-221ENST00000514231 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PDE4D-221ENST00000514231 RUSC1Q9BVN2 902 aa9.81□□□□□ -0.84
PDE4D-221ENST00000514231 TREHO43280 583 aa9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-221ENST00000514231 GSTM4Q03013 218 aa9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-221ENST00000514231 ARMC10Q8N2F6 343 aa9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-221ENST00000514231 TRAK1Q9UPV9 953 aa9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-221ENST00000514231 DHX15O43143 795 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-221ENST00000514231 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-221ENST00000514231 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-221ENST00000514231 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-221ENST00000514231 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-221ENST00000514231 RAXQ9Y2V3 346 aa9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-221ENST00000514231 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa9.78□□□□□ -0.84
PDE4D-221ENST00000514231 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PDE4D-221ENST00000514231 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PDE4D-221ENST00000514231 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa9.78□□□□□ -0.84
PDE4D-221ENST00000514231 PPP4R2Q9NY27 417 aa9.78□□□□□ -0.84
PDE4D-221ENST00000514231 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-221ENST00000514231 SART1O43290 800 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-221ENST00000514231 NUTM2GQ5VZR2 741 aa9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-221ENST00000514231 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-221ENST00000514231 MYRFLQ96LU7 910 aa9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-221ENST00000514231 USP26Q9BXU7 913 aa9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-221ENST00000514231 NRSN2Q9GZP1 204 aa9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF576Q9H609 170 aa9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-221ENST00000514231 ABCB6Q9NP58 842 aa9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-221ENST00000514231 NLRP2Q9NX02 1062 aa9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-221ENST00000514231 STOML1Q9UBI4 398 aa9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-221ENST00000514231 B3GALT4O96024 378 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-221ENST00000514231 CYP11A1P05108 521 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-221ENST00000514231 GRM2Q14416 872 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-221ENST00000514231 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-221ENST00000514231 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-221ENST00000514231 FDX2Q6P4F2 183 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-221ENST00000514231 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-221ENST00000514231 GLIS3Q8NEA6 775 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-221ENST00000514231 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-221ENST00000514231 SUGCTQ9HAC7 445 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-221ENST00000514231 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-221ENST00000514231 CYP4F12Q9HCS2 524 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-221ENST00000514231 DLGAP3O95886 979 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-221ENST00000514231 ASB16Q96NS5 453 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-221ENST00000514231 FSTP19883 344 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-221ENST00000514231 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-221ENST00000514231 HIF3AQ9Y2N7 669 aa9.74□□□□□ -0.85
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