RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510021.5

UBE2B-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 415 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-207ENST00000510021 TNFRSF10AO00220 468 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 GTF2A2P52657 109 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 PROSER3Q2NL68 480 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 FAM161BQ96MY7 647 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 OSBPP22059 807 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 ANXA1P04083 346 aa20.24■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 PSMC4P43686 418 aa20.24■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 STRIP1Q5VSL9 837 aa20.24■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 FAM89AQ96GI7 184 aa20.24■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 PIEZO1Q92508 2521 aa20.24■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 ZNF804BA4D1E1 1349 aa20.24■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 MYPNQ86TC9 1320 aa20.24■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 SYN1P17600 705 aa20.23■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 CAPN2P17655 700 aa20.23■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 HOXD10P28358 340 aa20.23■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 FBXW7Q969H0 707 aa20.23■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 XDHP47989 1333 aa20.23■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 TMEM265A0A087WTH1 108 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 KIAA0825Q8IV33 1275 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 SEC31BQ9NQW1 1179 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 NCOR1O75376 2440 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 C17orf99Q6UX52 265 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 COPS6Q7L5N1 327 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 MED23Q9ULK4 1368 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2B-207ENST00000510021 ATP2B4P23634 1241 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 NECAB2Q7Z6G3 386 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 BDP1A6H8Y1 2624 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 MAP3K12Q12852 859 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 SLAIN1Q8ND83 568 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 DEFB118Q96PH6 123 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 BTBD19C9JJ37 291 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 DLGAP5Q15398 846 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 PRKCZQ05513 592 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 ZNF697Q5TEC3 545 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 CPA4Q9UI42 421 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 ADGRA2Q96PE1 1338 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 CDH23Q9H251 3354 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 VGLL4Q14135 290 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 TJAP1Q5JTD0 557 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 CLRN2A0PK11 232 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 CETPP11597 493 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.15■□□□□ 0.82
UBE2B-207ENST00000510021 DLG5Q8TDM6 1919 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2B-207ENST00000510021 RASA3Q14644 834 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2B-207ENST00000510021 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
UBE2B-207ENST00000510021 TTLL5Q6EMB2 1281 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2B-207ENST00000510021 COA1Q9GZY4 146 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2B-207ENST00000510021 MGAMO43451 1857 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2B-207ENST00000510021 AOX1Q06278 1338 aa20.13■□□□□ 0.81
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UBE2B-207ENST00000510021 VEZTQ9HBM0 779 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2B-207ENST00000510021 GABRQQ9UN88 632 aa20.12■□□□□ 0.81
UBE2B-207ENST00000510021 SPDYE5A6NIY4 337 aa20.11■□□□□ 0.81
UBE2B-207ENST00000510021 MYO1BO43795 1136 aa20.11■□□□□ 0.81
UBE2B-207ENST00000510021 ADCY3O60266 1144 aa20.11■□□□□ 0.81
UBE2B-207ENST00000510021 MAP3K9P80192 1104 aa20.11■□□□□ 0.81
UBE2B-207ENST00000510021 ANKLE1Q8NAG6 615 aa20.11■□□□□ 0.81
UBE2B-207ENST00000510021 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
UBE2B-207ENST00000510021 SNX27Q96L92 541 aa20.11■□□□□ 0.81
UBE2B-207ENST00000510021 SPDYE2BA6NHP3 402 aa20.1■□□□□ 0.81
UBE2B-207ENST00000510021 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.1■□□□□ 0.81
UBE2B-207ENST00000510021 SPDYE6P0CI01 402 aa20.1■□□□□ 0.81
UBE2B-207ENST00000510021 ELNP15502 786 aa20.1■□□□□ 0.81
UBE2B-207ENST00000510021 TXNRD3Q86VQ6 643 aa20.1■□□□□ 0.81
UBE2B-207ENST00000510021 MYLIPQ8WY64 445 aa20.1■□□□□ 0.81
UBE2B-207ENST00000510021 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
UBE2B-207ENST00000510021 CSADQ9Y600 493 aa20.09■□□□□ 0.81
UBE2B-207ENST00000510021 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
UBE2B-207ENST00000510021 FCGRTP55899 365 aa20.08■□□□□ 0.81
UBE2B-207ENST00000510021 GTF2IP78347 998 aa20.08■□□□□ 0.81
UBE2B-207ENST00000510021 SNAPC2Q13487 334 aa20.08■□□□□ 0.81
UBE2B-207ENST00000510021 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa20.08■□□□□ 0.81
UBE2B-207ENST00000510021 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.08■□□□□ 0.81
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