RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506437.1

ITGA3-208, Transcript of integrin subunit alpha 3, human

TSL 2

Gene ITGA3, Length 3,055 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ITGA3-208	ENST00000506437	CCDC102B	Q68D86	513 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	MCAM	P43121	646 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	ZAP70	P43403	619 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	ZNF609	O15014	1411 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	UFL1	O94874	794 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	VPS37D	Q86XT2	251 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	MTFR1L	Q9H019	292 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	13.67	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	PDE6B	P35913	854 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	POLL	Q9UGP5	575 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	PCNT	O95613	3336 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	FBXW7	Q969H0	707 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	FAM227B	Q96M60	508 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	PRR29	P0C7W0	189 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	POLD1	P28340	1107 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	DOK7	Q18PE1	504 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	FSD1	Q9BTV5	496 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	LPIN2	Q92539	896 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	STAP2	Q9UGK3	403 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	FGFR2	P21802	821 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	RASGRF1	Q13972	1273 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	MASTL	Q96GX5	879 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	GPATCH3	Q96I76	525 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	ABCF2	Q9UG63	623 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	SLX4	Q8IY92	1834 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	SLC5A1	P13866	664 aa		13.65	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	NPR1	P16066	1061 aa		13.65	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	PTGER2	P43116	358 aa		13.65	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	WASHC4	Q2M389	1173 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	MXD3	Q9BW11	206 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	ERC2	O15083	957 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	RGL2	O15211	777 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	CAPN2	P17655	700 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	KCNA3	P22001	575 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	BCS1L	Q9Y276	419 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	TAF3	Q5VWG9	929 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	RTL9	Q8NET4	1388 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	ATP5J	P18859	108 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437		A0A0D9SFI3	127 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	CNTROB	Q8N137	903 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	CDC45	O75419	566 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	CHML	P26374	656 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	GRIK5	Q16478	980 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	13.61	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437		F8W031	263 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	BBOX1	O75936	387 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	GGA1	Q9UJY5	639 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	XDH	P47989	1333 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	ALDH1B1	P30837	517 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ITGA3-208	ENST00000506437	SPATA5	Q8NB90	893 aa		13.6	□□□□□ -0.23

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