RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504823.5

FAM200B-208, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

TSL 3

Gene FAM200B, Length 635 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-208	ENST00000504823	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		12.86	□□□□□ -0.35
FAM200B-208	ENST00000504823	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		12.86	□□□□□ -0.35
FAM200B-208	ENST00000504823	ZNF609	O15014	1411 aa		12.86	□□□□□ -0.35
FAM200B-208	ENST00000504823	TAF1	P21675	1872 aa		12.85	□□□□□ -0.35
FAM200B-208	ENST00000504823	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
FAM200B-208	ENST00000504823	RGMB	Q6NW40	437 aa		12.85	□□□□□ -0.35
FAM200B-208	ENST00000504823	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		12.85	□□□□□ -0.35
FAM200B-208	ENST00000504823	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
FAM200B-208	ENST00000504823	CCDC102A	Q96A19	550 aa		12.85	□□□□□ -0.35
FAM200B-208	ENST00000504823	RTL9	Q8NET4	1388 aa		12.84	□□□□□ -0.35
FAM200B-208	ENST00000504823	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		12.84	□□□□□ -0.35
FAM200B-208	ENST00000504823	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		12.84	□□□□□ -0.35
FAM200B-208	ENST00000504823	DGKZ	Q13574	1117 aa		12.84	□□□□□ -0.35
FAM200B-208	ENST00000504823	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		12.84	□□□□□ -0.35
FAM200B-208	ENST00000504823	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		12.84	□□□□□ -0.35
FAM200B-208	ENST00000504823	ZIC5	Q96T25	663 aa		12.84	□□□□□ -0.35
FAM200B-208	ENST00000504823	EYA3	Q99504	573 aa		12.84	□□□□□ -0.35
FAM200B-208	ENST00000504823	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		12.84	□□□□□ -0.35
FAM200B-208	ENST00000504823	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
FAM200B-208	ENST00000504823	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		12.84	□□□□□ -0.35
FAM200B-208	ENST00000504823	POLL	Q9UGP5	575 aa		12.84	□□□□□ -0.35
FAM200B-208	ENST00000504823	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
FAM200B-208	ENST00000504823	COL4A1	P02462	1669 aa		12.83	□□□□□ -0.35
FAM200B-208	ENST00000504823	GPSM2	P81274	684 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	ECE2	O60344	883 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	EGFR	P00533	1210 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	RALBP1	Q15311	655 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	PACS2	Q86VP3	889 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	NECTIN2	Q92692	538 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	FAM89A	Q96GI7	184 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	SLC10A3	P09131	477 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	PRSS12	P56730	875 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	KRT24	Q2M2I5	525 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	DLK2	Q6UY11	383 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	ADM5	C9JUS6	153 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	C6orf229	H3BNL8	230 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	HYPK	Q9NX55	129 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	RNF186	Q9NXI6	227 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	PSME4	Q14997	1843 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	SCN9A	Q15858	1988 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	FKBP1B	P68106	108 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	SULF1	Q8IWU6	871 aa		12.78	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	RUNDC1	Q96C34	613 aa		12.78	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	CSRNP1	Q96S65	589 aa		12.78	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	GGA3	Q9NZ52	723 aa		12.78	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		12.78	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		12.78	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		12.77	□□□□□ -0.36
FAM200B-208	ENST00000504823	TRPA1	O75762	1119 aa		12.77	□□□□□ -0.37
FAM200B-208	ENST00000504823	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
FAM200B-208	ENST00000504823	CDCA5	Q96FF9	252 aa		12.77	□□□□□ -0.37
FAM200B-208	ENST00000504823	GML	Q99445	158 aa		12.77	□□□□□ -0.37
FAM200B-208	ENST00000504823	SMAP	O00193	183 aa		12.76	□□□□□ -0.37
FAM200B-208	ENST00000504823	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		12.76	□□□□□ -0.37
FAM200B-208	ENST00000504823	LRCH3	Q96II8	777 aa		12.76	□□□□□ -0.37
FAM200B-208	ENST00000504823	GGA1	Q9UJY5	639 aa		12.76	□□□□□ -0.37
FAM200B-208	ENST00000504823	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
FAM200B-208	ENST00000504823	C3orf80	F5H4A9	247 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-208	ENST00000504823	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-208	ENST00000504823	UFL1	O94874	794 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-208	ENST00000504823	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-208	ENST00000504823	ZNF853	P0CG23	659 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-208	ENST00000504823	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-208	ENST00000504823	SCARF1	Q14162	830 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-208	ENST00000504823	NEUROD2	Q15784	382 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-208	ENST00000504823	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-208	ENST00000504823	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-208	ENST00000504823	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-208	ENST00000504823	PODN	Q7Z5L7	613 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-208	ENST00000504823	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-208	ENST00000504823	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-208	ENST00000504823	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-208	ENST00000504823	ZNF428	Q96B54	188 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-208	ENST00000504823	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		12.75	□□□□□ -0.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.8 ms