RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 IGKV5-2P06315 115 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-210ENST00000503258 SP3Q02447 781 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-210ENST00000503258 SLC10A4Q96EP9 437 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-210ENST00000503258 CD209Q9NNX6 404 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-210ENST00000503258 RIMBP2O15034 1052 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-210ENST00000503258 NEXNQ0ZGT2 675 aa9.92□□□□□ -0.82
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PDE4D-210ENST00000503258 UBE4AQ14139 1066 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-210ENST00000503258 ANKLE1Q8NAG6 615 aa9.92□□□□□ -0.82
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PDE4D-210ENST00000503258 TNNI2P48788 182 aa9.92□□□□□ -0.82
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PDE4D-210ENST00000503258 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-210ENST00000503258 SEC31BQ9NQW1 1179 aa9.92□□□□□ -0.82
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PDE4D-210ENST00000503258 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP9.91□□□□□ -0.82
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PDE4D-210ENST00000503258 MYD88Q99836 296 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-210ENST00000503258 DEFB129Q9H1M3 183 aa9.91□□□□□ -0.82
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PDE4D-210ENST00000503258 ALDH1L1O75891 902 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-210ENST00000503258 CETPP11597 493 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-210ENST00000503258 EFCC1Q9HA90 598 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-210ENST00000503258 FOCADQ5VW36 1801 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-210ENST00000503258 SALL1Q9NSC2 1324 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-210ENST00000503258 UTRNP46939 3433 aa9.9□□□□□ -0.82
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PDE4D-210ENST00000503258 MAP3K9P80192 1104 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-210ENST00000503258 GCKRQ14397 625 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-210ENST00000503258 TTLL5Q6EMB2 1281 aa9.9□□□□□ -0.82
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PDE4D-210ENST00000503258 SASH1O94885 1247 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-210ENST00000503258 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-210ENST00000503258 PPATQ06203 517 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.89□□□□□ -0.83
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PDE4D-210ENST00000503258 PXYLP1Q8TE99 480 aa9.89□□□□□ -0.83
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PDE4D-210ENST00000503258 MROH5Q6ZUA9 1318 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-210ENST00000503258 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa9.89□□□□□ -0.83
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PDE4D-210ENST00000503258 HHIPL2Q6UWX4 724 aa9.89□□□□□ -0.83
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PDE4D-210ENST00000503258 C17orf99Q6UX52 265 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-210ENST00000503258 ERO1BQ86YB8 467 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-210ENST00000503258 GREM2Q9H772 168 aa9.88□□□□□ -0.83
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PDE4D-210ENST00000503258 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-210ENST00000503258 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-210ENST00000503258 ZDHHC15Q96MV8 337 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-210ENST00000503258 GINM1Q9NU53 330 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-210ENST00000503258 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-210ENST00000503258 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-210ENST00000503258 TRIM17Q9Y577 477 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-210ENST00000503258 ALPK3Q96L96 1907 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-210ENST00000503258 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-210ENST00000503258 GJA8P48165 433 aa9.87□□□□□ -0.83
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PDE4D-210ENST00000503258 GJB1P08034 283 aa9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-210ENST00000503258 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-210ENST00000503258 POTEFA5A3E0 1075 aa9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-210ENST00000503258 SEMA3EO15041 775 aa9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-210ENST00000503258 ITGA6P23229 1130 aa9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-210ENST00000503258 SNAPC2Q13487 334 aa9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-210ENST00000503258 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-210ENST00000503258 STK31Q9BXU1 1019 aa9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-210ENST00000503258 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa9.86□□□□□ -0.83
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