RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496281.1

RTEL1-TNFRSF6B-204, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,314 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PTPDC1A2A3K4 754 aa20.52■□□□□ 0.88
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CABP5Q9NP86 173 aa20.5■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ABCC2Q92887 1545 aa20.5■□□□□ 0.87
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GSTO1P78417 241 aa20.48■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 WDR78Q5VTH9 848 aa20.48■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SYCP3Q8IZU3 236 aa20.48■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.48■□□□□ 0.87
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ARHGAP6O43182 974 aa20.47■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TRIM14Q14142 442 aa20.47■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LZTFL1Q9NQ48 299 aa20.47■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SAMM50Q9Y512 469 aa20.47■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 VAV2P52735 878 aa20.47■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PPM1EQ8WY54 764 aa20.47■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 AFAP1L1Q8TED9 768 aa20.46■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 BABAM1Q9NWV8 329 aa20.46■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.46■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TBCAO75347 108 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
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