RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 CCDC27Q2M243 656 aa29.49■■■□□ 2.31
SIMC1-208ENST00000495423 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
SIMC1-208ENST00000495423 OTOFQ9HC10 1997 aa29.48■■■□□ 2.31
SIMC1-208ENST00000495423 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
SIMC1-208ENST00000495423 DLGAP5Q15398 846 aa29.48■■■□□ 2.31
SIMC1-208ENST00000495423 MYH16Q9H6N6 1097 aa29.48■■■□□ 2.31
SIMC1-208ENST00000495423 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa29.48■■■□□ 2.31
SIMC1-208ENST00000495423 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
SIMC1-208ENST00000495423 FLIIQ13045 1269 aa29.47■■■□□ 2.31
SIMC1-208ENST00000495423 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
SIMC1-208ENST00000495423 CERS5Q8N5B7 392 aa29.47■■■□□ 2.31
SIMC1-208ENST00000495423 FZD1Q9UP38 647 aa29.47■■■□□ 2.31
SIMC1-208ENST00000495423 CENPFP49454 3210 aa29.47■■■□□ 2.31
SIMC1-208ENST00000495423 UNCXA6NJT0 531 aa29.46■■■□□ 2.31
SIMC1-208ENST00000495423 IFNL1Q8IU54 200 aa29.46■■■□□ 2.31
SIMC1-208ENST00000495423 LINS1Q8NG48 757 aa29.46■■■□□ 2.31
SIMC1-208ENST00000495423 SLC10A4Q96EP9 437 aa29.46■■■□□ 2.31
SIMC1-208ENST00000495423 DNAAF4Q8WXU2 420 aa29.45■■■□□ 2.31
SIMC1-208ENST00000495423 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
SIMC1-208ENST00000495423 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa29.44■■■□□ 2.3
SIMC1-208ENST00000495423 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
SIMC1-208ENST00000495423 WNK4Q96J92 1243 aa29.44■■■□□ 2.3
SIMC1-208ENST00000495423 ARAP2Q8WZ64 1704 aa29.44■■■□□ 2.3
SIMC1-208ENST00000495423 IL1R1P14778 569 aa29.43■■■□□ 2.3
SIMC1-208ENST00000495423 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
SIMC1-208ENST00000495423 WWC1Q8IX03 1113 aa29.43■■■□□ 2.3
SIMC1-208ENST00000495423 IL16Q14005 1332 aa29.43■■■□□ 2.3
SIMC1-208ENST00000495423 SNAP23O00161 211 aa29.42■■■□□ 2.3
SIMC1-208ENST00000495423 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
SIMC1-208ENST00000495423 CLMNQ96JQ2 1002 aa29.42■■■□□ 2.3
SIMC1-208ENST00000495423 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa29.42■■■□□ 2.3
SIMC1-208ENST00000495423 SPDYE2BA6NHP3 402 aa29.41■■■□□ 2.3
SIMC1-208ENST00000495423 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP29.41■■■□□ 2.3
SIMC1-208ENST00000495423 TAF5LO75529 589 aa29.41■■■□□ 2.3
SIMC1-208ENST00000495423 SPDYE6P0CI01 402 aa29.41■■■□□ 2.3
SIMC1-208ENST00000495423 MYO1BO43795 1136 aa29.4■■■□□ 2.3
SIMC1-208ENST00000495423 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa29.4■■■□□ 2.3
SIMC1-208ENST00000495423 CFAP100Q494V2 611 aa29.4■■■□□ 2.3
SIMC1-208ENST00000495423 OTOP1Q7RTM1 612 aa29.4■■■□□ 2.3
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF804AQ7Z570 1209 aa29.4■■■□□ 2.3
SIMC1-208ENST00000495423 TRIM17Q9Y577 477 aa29.4■■■□□ 2.3
SIMC1-208ENST00000495423 FOXO4P98177 505 aa29.39■■■□□ 2.3
SIMC1-208ENST00000495423 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
SIMC1-208ENST00000495423 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
SIMC1-208ENST00000495423 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
SIMC1-208ENST00000495423 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
SIMC1-208ENST00000495423 CLRN2A0PK11 232 aa29.37■■■□□ 2.29
SIMC1-208ENST00000495423 F8W031 263 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
SIMC1-208ENST00000495423 IREB2P48200 963 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
SIMC1-208ENST00000495423 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
SIMC1-208ENST00000495423 FAM9BQ8IZU0 186 aa29.36■■■□□ 2.29
SIMC1-208ENST00000495423 ERO1AQ96HE7 468 aa29.36■■■□□ 2.29
SIMC1-208ENST00000495423 AOX1Q06278 1338 aa29.36■■■□□ 2.29
SIMC1-208ENST00000495423 BRCA2P51587 3418 aa29.35■■■□□ 2.29
SIMC1-208ENST00000495423 USP2O75604 605 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
SIMC1-208ENST00000495423 GCC1Q96CN9 775 aa29.35■■■□□ 2.29
SIMC1-208ENST00000495423 VEZTQ9HBM0 779 aa29.35■■■□□ 2.29
SIMC1-208ENST00000495423 GJA5P36382 358 aa29.34■■■□□ 2.29
SIMC1-208ENST00000495423 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa29.34■■■□□ 2.29
SIMC1-208ENST00000495423 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa29.34■■■□□ 2.29
SIMC1-208ENST00000495423 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
SIMC1-208ENST00000495423 FANCIQ9NVI1 1328 aa29.34■■■□□ 2.29
SIMC1-208ENST00000495423 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
SIMC1-208ENST00000495423 CRHR2Q13324 411 aa29.33■■■□□ 2.29
SIMC1-208ENST00000495423 PTPN22Q9Y2R2 807 aa29.33■■■□□ 2.29
SIMC1-208ENST00000495423 FAM205AQ6ZU69 1335 aa29.33■■■□□ 2.29
SIMC1-208ENST00000495423 VAMP4O75379 141 aa29.32■■■□□ 2.28
SIMC1-208ENST00000495423 RASA3Q14644 834 aa29.32■■■□□ 2.28
SIMC1-208ENST00000495423 BEND3Q5T5X7 828 aa29.32■■■□□ 2.28
SIMC1-208ENST00000495423 CHMP3Q9Y3E7 222 aa29.32■■■□□ 2.28
SIMC1-208ENST00000495423 POTEFA5A3E0 1075 aa29.31■■■□□ 2.28
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SIMC1-208ENST00000495423 CD99L2Q8TCZ2 262 aa29.3■■■□□ 2.28
SIMC1-208ENST00000495423 PTPN18Q99952 460 aa29.3■■■□□ 2.28
SIMC1-208ENST00000495423 JAG2Q9Y219 1238 aa29.3■■■□□ 2.28
SIMC1-208ENST00000495423 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP29.29■■■□□ 2.28
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SIMC1-208ENST00000495423 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa29.29■■■□□ 2.28
SIMC1-208ENST00000495423 ARMC5Q96C12 935 aa29.29■■■□□ 2.28
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SIMC1-208ENST00000495423 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
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SIMC1-208ENST00000495423 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
SIMC1-208ENST00000495423 EFCC1Q9HA90 598 aa29.27■■■□□ 2.28
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
SIMC1-208ENST00000495423 MFSD14BQ5SR56 506 aa29.26■■■□□ 2.27
SIMC1-208ENST00000495423 OPTNQ96CV9 577 aa29.26■■■□□ 2.27
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SIMC1-208ENST00000495423 GRM8O00222 908 aa29.25■■■□□ 2.27
SIMC1-208ENST00000495423 PLIN1O60240 522 aa29.25■■■□□ 2.27
SIMC1-208ENST00000495423 UBE4AQ14139 1066 aa29.25■■■□□ 2.27
SIMC1-208ENST00000495423 TAF7LQ5H9L4 462 aa29.25■■■□□ 2.27
SIMC1-208ENST00000495423 MS4A4AQ96JQ5 239 aa29.25■■■□□ 2.27
SIMC1-208ENST00000495423 TEPSINQ96N21 525 aa29.25■■■□□ 2.27
SIMC1-208ENST00000495423 ELP3Q9H9T3 547 aa29.25■■■□□ 2.27
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