RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 GPR162Q16538 588 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 TAOK3Q9H2K8 898 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 FAM205AQ6ZU69 1335 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 IGKV5-2P06315 115 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 MCCP23508 829 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 FKBP1CQ5VVH2 108 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 CNBD1Q8NA66 436 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 H7C1W4 665 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 NEXNQ0ZGT2 675 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 AACSQ86V21 672 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 NLRP10Q86W26 655 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 KAZALD1Q96I82 304 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 ARID3AQ99856 593 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 MCTP1Q6DN14 999 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 SETDB2Q96T68 719 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 DTNBO60941 627 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 SLC34A2O95436 690 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 NCLP19338 710 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 CNTROBQ8N137 903 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 TMX3Q96JJ7 454 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 BAG4O95429 457 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 EPHA10Q5JZY3 1008 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 PANK2Q9BZ23 570 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 ZNF804BA4D1E1 1349 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 LAMA4Q16363 1823 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 MYH7P12883 1935 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 GOLGA6L22H0YM25 854 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 ROBO3Q96MS0 1386 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 NEURL1BA8MQ27 555 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 SASH1O94885 1247 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 CPA1P15085 419 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 ECHDC1Q9NTX5 307 aa8.43□□□□□ -1.06
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HERC4-211ENST00000492996 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 LTBP2Q14767 1821 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 SGSM2O43147 1006 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 IL1R1P14778 569 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 MTX1Q13505 466 aa8.42□□□□□ -1.06
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HERC4-211ENST00000492996 BOLA2Q9H3K6 86 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 HACL1Q9UJ83 578 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 AOX1Q06278 1338 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 NUCB2P80303 420 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 PDCL3Q9H2J4 239 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 GINM1Q9NU53 330 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 SCNN1DP51172 638 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 RASEFQ8IZ41 740 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 HDAC5Q9UQL6 1122 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 TM4SF4P48230 202 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 TNIP1Q15025 636 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 TPRNQ4KMQ1 711 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 GPATCH3Q96I76 525 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 ZNRF3Q9ULT6 936 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 LEMD3Q9Y2U8 911 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 A1BGP04217 495 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 ERC1Q8IUD2 1116 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 PLCD3Q8N3E9 789 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 GPRC5DQ9NZD1 345 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 PRDM4Q9UKN5 801 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 ZDHHC9Q9Y397 364 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 ADGRA2Q96PE1 1338 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 PTH1RQ03431 593 aa8.41□□□□□ -1.06
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