RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489850.5

NOM1-208, Transcript of nucleolar protein with MIF4G domain 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NOM1, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1-208ENST00000489850 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa25.33■■□□□ 1.65
NOM1-208ENST00000489850 TRPM4Q8TD43 1214 aa25.33■■□□□ 1.65
NOM1-208ENST00000489850 PGAP2Q9UHJ9 254 aa25.33■■□□□ 1.65
NOM1-208ENST00000489850 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
NOM1-208ENST00000489850 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.32■■□□□ 1.64
NOM1-208ENST00000489850 CNTROBQ8N137 903 aa25.32■■□□□ 1.64
NOM1-208ENST00000489850 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa25.32■■□□□ 1.64
NOM1-208ENST00000489850 MXD3Q9BW11 206 aa25.32■■□□□ 1.64
NOM1-208ENST00000489850 MYOZ2Q9NPC6 264 aa25.32■■□□□ 1.64
NOM1-208ENST00000489850 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
NOM1-208ENST00000489850 A0A1B0GUL7 405 aa25.31■■□□□ 1.64
NOM1-208ENST00000489850 APLP1P51693 650 aa25.31■■□□□ 1.64
NOM1-208ENST00000489850 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
NOM1-208ENST00000489850 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
NOM1-208ENST00000489850 ZBTB22O15209 634 aa25.3■■□□□ 1.64
NOM1-208ENST00000489850 MFSD14BQ5SR56 506 aa25.3■■□□□ 1.64
NOM1-208ENST00000489850 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
NOM1-208ENST00000489850 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.3■■□□□ 1.64
NOM1-208ENST00000489850 KIAA0825Q8IV33 1275 aa25.3■■□□□ 1.64
NOM1-208ENST00000489850 GPR108Q9NPR9 543 aa25.3■■□□□ 1.64
NOM1-208ENST00000489850 SEMA3EO15041 775 aa25.29■■□□□ 1.64
NOM1-208ENST00000489850 CERS5Q8N5B7 392 aa25.29■■□□□ 1.64
NOM1-208ENST00000489850 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
NOM1-208ENST00000489850 TIMM10P62072 90 aa25.28■■□□□ 1.64
NOM1-208ENST00000489850 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
NOM1-208ENST00000489850 JAG2Q9Y219 1238 aa25.28■■□□□ 1.64
NOM1-208ENST00000489850 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.27■■□□□ 1.64
NOM1-208ENST00000489850 EGFRP00533 1210 aa25.27■■□□□ 1.64
NOM1-208ENST00000489850 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
NOM1-208ENST00000489850 XAGE2Q96GT9 111 aa25.27■■□□□ 1.64
NOM1-208ENST00000489850 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.27■■□□□ 1.64
NOM1-208ENST00000489850 PASKQ96RG2 1323 aa25.27■■□□□ 1.64
NOM1-208ENST00000489850 GORABQ5T7V8 394 aa25.26■■□□□ 1.63
NOM1-208ENST00000489850 CCDC102BQ68D86 513 aa25.26■■□□□ 1.63
NOM1-208ENST00000489850 WDR66Q8TBY9 1149 aa25.26■■□□□ 1.63
NOM1-208ENST00000489850 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
NOM1-208ENST00000489850 DENND2AQ9ULE3 1009 aa25.26■■□□□ 1.63
NOM1-208ENST00000489850 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa25.26■■□□□ 1.63
NOM1-208ENST00000489850 ADORA1P30542 326 aa25.25■■□□□ 1.63
NOM1-208ENST00000489850 SCARF1Q14162 830 aa25.25■■□□□ 1.63
NOM1-208ENST00000489850 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.25■■□□□ 1.63
NOM1-208ENST00000489850 PHKA1P46020 1223 aa25.24■■□□□ 1.63
NOM1-208ENST00000489850 TNNI3KQ59H18 835 aa25.24■■□□□ 1.63
NOM1-208ENST00000489850 SIRT2Q8IXJ6 389 aa25.24■■□□□ 1.63
NOM1-208ENST00000489850 MTMR14Q8NCE2 650 aa25.24■■□□□ 1.63
NOM1-208ENST00000489850 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.24■■□□□ 1.63
NOM1-208ENST00000489850 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.24■■□□□ 1.63
NOM1-208ENST00000489850 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
NOM1-208ENST00000489850 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa25.23■■□□□ 1.63
NOM1-208ENST00000489850 F8W031 263 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
NOM1-208ENST00000489850 GGA3Q9NZ52 723 aa25.23■■□□□ 1.63
NOM1-208ENST00000489850 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
NOM1-208ENST00000489850 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
NOM1-208ENST00000489850 MAST3O60307 1309 aa25.22■■□□□ 1.63
NOM1-208ENST00000489850 WNT10BO00744 389 aa25.22■■□□□ 1.63
NOM1-208ENST00000489850 AAMPQ13685 434 aa25.22■■□□□ 1.63
NOM1-208ENST00000489850 DLGAP5Q15398 846 aa25.22■■□□□ 1.63
NOM1-208ENST00000489850 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.22■■□□□ 1.63
NOM1-208ENST00000489850 SULF1Q8IWU6 871 aa25.22■■□□□ 1.63
NOM1-208ENST00000489850 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.22■■□□□ 1.63
NOM1-208ENST00000489850 RAB11FIP3O75154 756 aa25.21■■□□□ 1.63
NOM1-208ENST00000489850 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
NOM1-208ENST00000489850 CREBZFQ9NS37 354 aa25.21■■□□□ 1.63
NOM1-208ENST00000489850 SALL1Q9NSC2 1324 aa25.2■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 MYO1BO43795 1136 aa25.2■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 NBPF9Q3BBW0 867 aa25.2■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.2■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.2■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 TMEM88BA6NKF7 163 aa25.19■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.19■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 RASGRF1Q13972 1273 aa25.19■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 CFAP100Q494V2 611 aa25.19■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.19■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 USP48Q86UV5 1035 aa25.18■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.18■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 CRBNQ96SW2 442 aa25.18■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 MRIQ9BWK5 157 aa25.18■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 CEP350Q5VT06 3117 aa25.17■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 SPDYE2BA6NHP3 402 aa25.17■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 TRAF5O00463 557 aa25.17■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 SPDYE6P0CI01 402 aa25.17■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.16■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 TEKT1Q969V4 418 aa25.16■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 LDHBP07195 334 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 CRKP46108 304 aa25.15■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 SPATA5Q8NB90 893 aa25.15■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
NOM1-208ENST00000489850 DBNDD2Q9BQY9 259 aa25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms