RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 ITPKAP23677 461 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 ASAP3Q8TDY4 903 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 NUDT8Q8WV74 236 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 ZNF76P36508 570 aa8.12□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 SPRED3Q2MJR0 410 aa8.12□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 MEI1Q5TIA1 1274 aa8.12□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 ANKRD24Q8TF21 1146 aa8.12□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 BSNDQ8WZ55 320 aa8.12□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 AKAP2Q9Y2D5 859 aa8.12□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 SPDYE3A6NKU9 549 aa8.11□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 FAM177BA6PVY3 158 aa8.11□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 FANCCQ00597 558 aa8.11□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 KCNMA1Q12791 1236 aa8.11□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 RNF34Q969K3 372 aa8.11□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 ADAM19Q9H013 955 aa8.11□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 TRIM33Q9UPN9 1127 aa8.11□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.1□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 ZNF576Q9H609 170 aa8.1□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 NID1P14543 1247 aa8.09□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 CEP44Q9C0F1 390 aa8.09□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 LACRTQ9GZZ8 138 aa8.09□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 MUC3BQ9H195 1237 aa8.09□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 SOX13Q9UN79 622 aa8.09□□□□□ -1.11
CCL20-204ENST00000489160 CDC27P30260 824 aa8.08□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 TRIM11Q96F44 468 aa8.08□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 PLVAPQ9BX97 442 aa8.08□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 CABP4P57796 275 aa8.07□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 GRIK5Q16478 980 aa8.07□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 TRAPPC3LQ5T215 181 aa8.07□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 MSL1Q68DK7 614 aa8.07□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa8.07□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 SV2BQ7L1I2 683 aa8.07□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 HS2ST1Q7LGA3 356 aa8.07□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.07□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 PCDH1Q08174 1060 aa8.06□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 TPTE2Q6XPS3 522 aa8.06□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 NT5DC4Q86YG4 428 aa8.06□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 WFDC8Q8IUA0 241 aa8.06□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 IL22RA1Q8N6P7 574 aa8.06□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 GGT7Q9UJ14 662 aa8.06□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 H3BRJ5 948 aa8.05□□□□□ -1.12
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CCL20-204ENST00000489160 B3GALT4O96024 378 aa8.05□□□□□ -1.12
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CCL20-204ENST00000489160 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 C9orf131Q5VYM1 1079 aa8.05□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 ILDR2Q71H61 639 aa8.05□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 SEC31BQ9NQW1 1179 aa8.05□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 PPME1Q9Y570 386 aa8.05□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 EPHA1P21709 976 aa8.04□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 BAG6P46379 1132 aa8.04□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 RAC1P63000 192 aa8.04□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 PPP2R3AQ06190 1150 aa8.04□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 IKBKEQ14164 716 aa8.04□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 PRRT3Q5FWE3 981 aa8.04□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 DTWD1Q8N5C7 304 aa8.04□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.04□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 COL8A1P27658 744 aa8.03□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.03□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 FAM117BQ6P1L5 589 aa8.03□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 ERMP1Q7Z2K6 904 aa8.03□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 WNT8BQ93098 351 aa8.03□□□□□ -1.12
CCL20-204ENST00000489160 ENC1O14682 589 aa8.02□□□□□ -1.13
CCL20-204ENST00000489160 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CCL20-204ENST00000489160 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa8.02□□□□□ -1.13
CCL20-204ENST00000489160 GSK3AP49840 483 aa8.02□□□□□ -1.13
CCL20-204ENST00000489160 PIP4K2BP78356 416 aa8.02□□□□□ -1.13
CCL20-204ENST00000489160 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa8.02□□□□□ -1.13
CCL20-204ENST00000489160 PWP1Q13610 501 aa8.02□□□□□ -1.13
CCL20-204ENST00000489160 RSRP1Q9BUV0 290 aa8.02□□□□□ -1.13
CCL20-204ENST00000489160 TGIF2Q9GZN2 237 aa8.02□□□□□ -1.13
CCL20-204ENST00000489160 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CCL20-204ENST00000489160 A0A0A0MRY4 1105 aa8.01□□□□□ -1.13
CCL20-204ENST00000489160 GDF11O95390 407 aa8.01□□□□□ -1.13
CCL20-204ENST00000489160 CELA3AP09093 270 aa8.01□□□□□ -1.13
CCL20-204ENST00000489160 CDC25BP30305 580 aa8.01□□□□□ -1.13
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