RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486480.1

PTPRN-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-216ENST00000486480 JAG2Q9Y219 1238 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRN-216ENST00000486480 USP17L8P0C7I0 530 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 CLEC11AQ9Y240 323 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 EGFRP00533 1210 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 TIMM10P62072 90 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 SAMD7Q7Z3H4 446 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 GPR108Q9NPR9 543 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 PHKA1P46020 1223 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 ERC1Q8IUD2 1116 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 XAGE2Q96GT9 111 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 TNNI3KQ59H18 835 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 CCDC102BQ68D86 513 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 OGFOD1Q8N543 542 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 ECM29Q5VYK3 1845 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 MYOZ2Q9NPC6 264 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 SEMA3EO15041 775 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 MMP14P50281 582 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 HDAC9Q9UKV0 1011 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRN-216ENST00000486480 F8W031 263 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 ZBTB22O15209 634 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 PGAP2Q9UHJ9 254 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 GORABQ5T7V8 394 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 RHPN1Q8TCX5 695 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 TRPM7Q96QT4 1865 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 HSPA6P17066 643 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 RASGRF1Q13972 1273 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 CNTROBQ8N137 903 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 WDR66Q8TBY9 1149 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 AKAP11Q9UKA4 1901 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 APBB1O00213 710 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 RAB11FIP3O75154 756 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 KIF1BPQ96EK5 621 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 GRIK5Q16478 980 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 GGA3Q9NZ52 723 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 PASKQ96RG2 1323 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 AAMPQ13685 434 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 SCARF1Q14162 830 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 AACSQ86V21 672 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PTPRN-216ENST00000486480 WNT10BO00744 389 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 NBPF9Q3BBW0 867 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 SALL1Q9NSC2 1324 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 DLGAP5Q15398 846 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 CFAP100Q494V2 611 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 CCDC158Q5M9N0 1113 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 TTC39AQ5SRH9 613 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 MAST3O60307 1309 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 TRAF5O00463 557 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 APLP1P51693 650 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 CDC37L1Q7L3B6 337 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 DCTPP1Q9H773 170 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 HMG20BQ9P0W2 317 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 SPDYE2BA6NHP3 402 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 SPDYE6P0CI01 402 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRN-216ENST00000486480 MCAMP43121 646 aa23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms